Dette kapitlet diskuterer strukturen og mekanismen for citratsyntase. Enzymet citratsyntase som katalyserer reaksjonen ved inngangen til sitronsyresyklusen, danner et fremragende system for undersøkelse av enzymatiske mekanismer, enzym–substratinteraksjoner, konformasjonsendring, proteinfolding, kvaternær montering av biologiske strukturer og organellmålretting. Citratsyntase gir et system der det enkleste eksempelet på kvaternær strukturell montering til en aktiv oligomer kan studeres. I eukaryoter er enzymet en dimer hvor hver underenhet bidrar til funksjonelle grupper til det aktive stedet til den andre. Dimer kan reversibelt denatureres til inaktive monomerer. Enzymet krever ingen uvanlige kofaktorer eller metallioner for aktivitet; det er et av få enzymer som kan katalysere syntesen av en karbon–karbonbinding, og det gjør det med en hastighet som nærmer seg diffusjonsgrensen. Citratsyntase har blitt oppdaget i hovedsak hver organisme undersøkt. Enzymet katalyserer reversibel kondensering av acetyl-CoA for å danne citryl-CoA, som deretter hydrolyseres for å gi citrat og koenzym A. Således lukker enzymet sløyfen i sitronsyresyklusen, regenererer seks-karbonforbindelsen citrat fra firekarbonforbindelsen oksaloacetat.