useimmilla puuvartisilla kasveilla klooniset pesäkkeet syntyvät laajoista juurista, jotka lähettävät säännöllisin väliajoin uusia versoja, joita kutsutaan imijöiksi. Puut ja pensaat, joiden oksat voivat taipua ja levätä maassa, tai joilla on kyky muodostaa antenni juuret voivat muodostaa pesäkkeitä kautta kerrospukeutuminen, tai antenni juurtuvat, kuten paju, karhunvatukka, viikuna, ja banyan. Jotkin köynnökset muodostavat varsiinsa luonnostaan satunnaisia juuria, jotka juurtuvat maahan varsien kosketellessa maata, esimerkiksi muratti ja trumpettiköynnös. Muilla köynnöksillä varren juurtuminen, jossa solmut joutuvat kosketuksiin maaperän kanssa, voi muodostaa kloonisen yhdyskunnan, esimerkiksi wisterian. Saniaiset ja monet ruohovartiset kukkivat kasvit muodostavat usein kloonisia yhdyskuntia vaakasuorien maanalaisten juurakoiksi kutsuttujen varsien, esimerkiksi strutsisaniainen Matteuccia struthiopteris ja kultapiisku, kautta. Joukko ruohovartisia kukkivia kasveja muodostaa kloonisia yhdyskuntia vaakasuoran pinnan varsien kautta, joita kutsutaan stoloneiksi eli rönsyiksi; esimerkiksi mansikka ja monet heinäkasvit. Myös ei-puuvartiset kasvit, joilla on maanalaisia säilytyselimiä, kuten sipulit ja sukaset, voivat muodostaa pesäkkeitä, esimerkiksi Narcissus ja Krocus. Muutamat kasvilajit voivat muodostaa yhdyskuntia lehdille muodostuvien satunnaisten kasvien välityksellä, esimerkiksi Kalanchoe daigremontiana ja Tolmiea menziesii. Muutamat kasvilajit voivat muodostaa pesäkkeitä suvuttomien siementen, apomixis-nimisten siementen, esimerkiksi voikukan, välityksellä.