bij de meeste houtige planten ontstaan klonale kolonies door wijdverbreide wortels die met tussenpozen nieuwe scheuten naar boven sturen, zogenaamde uitlopers. Bomen en struiken met takken die de neiging hebben om te buigen en te rusten op de grond, of die de mogelijkheid hebben om luchtwortels te vormen kunnen kolonies vormen via gelaagdheid, of luchtworteling, bijvoorbeeld wilg, braam, vijg en banyan. Sommige wijnstokken vormen van nature onvoorziene wortels op hun stengels die wortel schieten in de grond wanneer de stengels in contact komen met de grond, bijvoorbeeld klimop en trompet wijnstok. Bij andere wijnstokken kan het wroeten van de stengel waar de knooppunten in contact komen met de bodem een klonale kolonie, bijvoorbeeld blauwe regen, tot stand brengen. Varens en veel kruidachtige bloeiende planten vormen vaak klonale kolonies via horizontale ondergrondse stengels die wortelstokken worden genoemd, bijvoorbeeld struisvogelvaren Matteuccia struthiopteris en guldenroede. Een aantal kruidachtige bloeiende planten vormen klonale kolonies via horizontale oppervlaktestelen die stolons of uitlopers worden genoemd; bijvoorbeeld aardbei en vele grassen. Niet-houtige planten met ondergrondse opslagorganen zoals bollen en knollen kunnen ook kolonies vormen, zoals narcissen en krokussen. Enkele plantensoorten kunnen kolonies vormen via toevallige plantlets die zich op bladeren vormen, zoals Kalanchoë daigremontiana en Tolmiea menziesii. Enkele plantensoorten kunnen kolonies vormen via aseksuele zaden, apomixis genoemd, bijvoorbeeld paardenbloem.