Monilääkitys lisää lääkkeiden yhteisvaikutusten riskiä. Aihiolääke klopidogreeli vaatii maksan sytokromi P450 (CYP) – metabolisen aktivaation, jotta saadaan aktiivinen metaboliitti, joka estää verihiutaleiden p2y12-adenosiinidifosfaattireseptoria (ADP), mikä vähentää verihiutaleiden aktivaatiota ja aggregaatioprosesseja. Atorvastatiinin, omepratsolin ja useiden muiden lääkkeiden on farmakodynaamisissa tutkimuksissa osoitettu estävän kompetitiivisesti klopidogreelin CYP-aktivaatiota ja vähentävän näin klopidogreelivastetta. Toisaalta muut lääkeaineet lisäävät klopidogreelivastetta indusoimalla CYP-aktiivisuutta. Näiden farmakodynaamisten yhteisvaikutusten kliiniset vaikutukset ovat herättäneet huolta, koska monia näistä lääkkeistä annetaan samanaikaisesti sepelvaltimotautia sairastaville potilaille. Farmakodynaamisen lääkeaineinteraktion kliinisesti merkittävän osoittamisessa on useita haasteita. Toistaiseksi ei ole yhdenmukaista näyttöä siitä, että klopidogreelilääkkeiden yhteisvaikutukset vaikuttaisivat sydän–ja verisuonitauteihin. Statiinien ja protonipumpun estäjien on osoitettu vähentävän haitallisia kliinisiä haittatapahtumia, eikä niitä pidä keskeyttää potilailta, joilla on sopivia hoitoaiheita, koska klopidogreelilääkkeiden mahdolliset yhteisvaikutukset ovat huolestuttavia. Kliinikot, jotka ovat huolissaan klopidogreelin ja lääkkeiden yhteisvaikutuksista, voivat määrätä joko vaihtoehtoisen trombosyytti p2y12-reseptorin estäjän ilman tunnettuja yhteisvaikutuksia, tai statiinia ja enterosuoja-aineita, jotka eivät häiritse klopidogreelin metaboliaa.