chakrat, eli ”pyörä”, ovat psyykkisiä keskuksia, jotka sijaitsevat selkärangan akselilla tietoisuuspotentiaaleina. Ne esitetään yleensä lotuksina. Chakrat eivät ole aineellisesti todellisia, ja niiden on ymmärrettävä sijaitsevan, ei karkeassa ruumiissa, vaan hienovaraisessa tai eteerisessä ruumiissa. Psyykkisten energioiden säilytyspaikat hallitsevat koko olemisen tilaa. Yleisimmin tunnetaan uudempi järjestelmä, joka on ajoitettu noin 700-luvulle ja jossa on tärkeimmät 7 chakraa. Mutta muinaiset hengelliset intiaanitekstit viittaavat moniin muihin järjestelmiin, joissa chakrojen määrä ja sijainti vaihtelevat.
kun Kundaliini lyödään, se herää ja alkaa nousta ylöspäin kuin tulinen käärme murtuen jokaisen chakransa päälle noustessaan, kunnes Shakti yhdistyy Shivan kanssa sahasrara-chakrassa.
Kundaliini saavuttaa jokaisen chakran, Lootus Avaa ja nostaa kukkansa; ja heti kun hän lähtee kohti korkeampaa chakraa, Lootus sulkee terälehtensä ja roikkuu alas, mikä symboloi chakran energioiden aktivoitumista ja niiden sulautumista kundaliiniin. Kundaliinin dynaamisuus, kun se siirtyy chakrasta toiseen, on henkisen tietoisuuden avautumista vaihe vaiheelta, ja sen sanotaan mahdollistavan siddhiksiksi kutsuttujen joogisten voimien hankkimisen.
lootuksen terälehtien lisääntyvän määrän, nousevassa järjestyksessä, voidaan katsoa osoittavan kunkin chakran nousevaa energiaa tai värähtelytaajuutta, ja kukin niistä toimii energian muuntajana voimasta toiseen. Kukin 6 ensimmäisen chakran 50 terälehdestä liittyy yhteen sanskritin aakkosten kirjaimista.
kukin chakroista vastaa tantrojen mukaan yhtä niistä alkuaineista, joista tunnettu maailma tiivistyy. Muladhara edustaa kiinteyttä; Svadhisthana, likviditeetti; Manipura, kaasumainen; Anahata, antenni; Vishuddha, eetteri eli avaruus. Koko prosessi voidaan nähdä elementtien asteittaisena muutoksena, jossa volatiliteetti kasvaa. Kukin viiden ensimmäisen chakran elementeistä liittyy ääneen: Lam, Vam, Ram, Yam, Ham.
tätä nousua chakrojen läpi voidaan pitää nousuna minän läpi, joka jalostaa ja sitoo energiaa, joka on Kundaliini, kunnes kuudennessa chakrassa, ajnassa, komentokeskuksessa, on tapahtunut laadullinen muutos. Chakrat ovat keskuksia, joissa psyykkinen tai henkinen energia muuttuu henkiseksi energiaksi.