selektiiviset serotoniinin takaisinoton estäjät (SSRI) masennuslääkkeet ovat tällä hetkellä hyödyllisimpiä masennuksen hoidossa. SSRI-lääkkeillä on eroja serotoniinin takaisinottoa estävien lääkkeiden tehossa, joskaan erot eivät korreloi kliinisen tehon kanssa. Viiden SSRI-lääkkeen (fluvoksamiini, fluoksetiini, paroksetiini, sertraliini ja sitalopraami) välillä on huomattavia farmakokineettisiä eroja. Näiden lääkkeiden optimaalinen käyttö edellyttää näiden erojen tuntemusta. Näistä farmakokineettisistä parametreista puoliintumisaika ja metaboliareitit ovat tärkeimmät. Niiden puoliintumisajassa on huomattavia eroja fluoksetiinin ja muiden SSRI-lääkkeiden välillä. Fluoksetiinin ja sen aktiivisen metaboliitin norfluoksetiinin puoliintumisaika on 2-4 päivää ja 7-15 päivää, pitempi kuin muiden SSRI-lääkkeiden (noin 1 päivä). Fluoksetiinin ja sen aktiivisen metaboliitin pidentynyt puoliintumisaika voi olla eduksi potilailla, jotka eivät noudata hoitotasapainoa, ja se voi olla mahdollinen turvallisuusetu lyhyempivaikutteisiin SSRI-lääkkeisiin verrattuna, kun hoito lopetetaan äkillisesti. Toisaalta tämä pitkä puoliintumisaika vaatii pitkän pesuajan (5 viikkoa) ennen kuin otetaan käyttöön muita lääkkeitä (MAO-estäjät, sumatriptaani), jotka voivat vaikuttaa serotoniinitoimintaan ja voivat johtaa serotoninergiseen oireyhtymään. SSRI-lääkkeet ovat voimakkaita maksan isoentsyymin P450-2D6 inhibiittoreita, ja niiden odotetaan vaikuttavan tämän entsyymin metaboloimien lääkkeiden puhdistumaan. Paroksetiini on voimakkain inhibiittori, jota seuraavat fluoksetiini, sertraliini, sitalopraami ja fluvoksamiini. Munuaistauti hidastaa sitalopraamin, paroksetiinin ja fluvoksamiinin metaboliittien eliminoitumista, ja iäkkäillä potilailla annoksia tulee pienentää. Toisaalta ikä tai munuaisten vajaatoiminta ja fluoksetiinin osalta lihavuus eivät vaikuta fluoksetiinin ja sertraliinin farmakokinetiikkaan.