CI-MS on massaspektroskooppinen tekniikka, jossa tutkittava aine reagoi reagenssikaasun ionien kanssa.
tavallisessa elektronien ionisaatiomassaspektrometriassa, EI-MS, tutkittavaan aineeseen pommitetaan energeettisiä elektroneja ionien tuottamiseksi. Energeettiset ionit hajoavat moniksi pirstoutumistuotteiksi.
kemiallisessa ionisaatiomassaspektrometriassa tutkittavassa aineessa on runsaasti reagenssikaasua, kuten metaania, ammoniakkia tai isobutaania.
elektronisuihku ionisoi reagenssikaasun mieluiten. Törmäykset muiden reagenssikaasumolekyylien kanssa synnyttävät ionisoituvan plasman.
tämän jälkeen plasma reagoi tutkittavan aineen kanssa muodostaen positiivisia ja negatiivisia ioneja.
CI on vähemmän energiaa kuluttava prosessi kuin EI. Se tuottaa usein vähemmän pirstaleisuutta ja yksinkertaisemman spektrin. CI-spektrissä on yleensä helposti tunnistettava molekyyli-ioni.
massaspektrejä analysoitaessa tunnistetaan ensin molekyylien ionit. Silloin palaset on melko helppo tunnistaa.
EI: llä voi olla molekyylien ioneja tai ne voivat olla liian heikkoja vahvistuakseen.
sen sijaan CI on pehmeämpi ionisaatiomenetelmä kuin EI. Pirstoutuminen on epätodennäköisempää, joten molekyylien ionit ovat näkyvämpiä.
esimerkiksi sokereista voidaan tehdä haihtuvampia muuntamalla niiden OH-ryhmät trimetyylisilyylieettereiksi (TMS).
ROH + (CH₃)₃SiCl → RO-Si (CH₃)₃
sakkaroosilla on 8 OH-ryhmää.
se muodostaa okta-TMS-eetterin molekyylikaavan C₃₆H₈₆O₁₁Si₈ kanssa.
EI-spektrissä ei ole havaittavissa olevaa molekyyli-Ionia.
sen sijaan REAGENSSIKAASUN CI-spektrissä ammoniakin kanssa on näkyvä molekyyli-ioni (M+NH₄)⁺.