yllä: kromatiinin ”puun” rakenne
NORTHWESTERN UNIVERSITY
tutkijat ovat selvittäneet, miten kromatiini, DNA: n ja proteiinien yhdistelmä, joka muodostaa kromosomeja, taittuu molekyylitasolla. Kromatiini koostuu oksista, jotka taipuvat takaisin itseensä ja ovat kiertyneet pitkin selkärankaa, jolloin rakenteeseen tulee aukkoja, jotka mahdollistavat sen tiiviin pakkaamisen, Science Advances-lehdessä viime perjantaina (10.tammikuuta) julkaistun tutkimuksen mukaan.
ryhmä, jota johtivat Igal szleifer ja Vadim Backman, molemmat Northwestern-yliopiston biolääketieteen insinöörejä, käytti matemaattista mallinnusta ja mikroskopiaa ymmärtääkseen ihmisen solujen 3-D-rakenteen nanokokoisessa geenissä. He havaitsivat, että kromatiini koostuu erikokoisista puumaisista domeeneista, jotka muodostavat ”3D-metsän”, tutkimuksen tekijät kirjoittavat. Tämän konfiguraation monimutkaisuus viittaa siihen, että kromatiinilla on aiemmin luultua enemmän organisaatiota ja rakenteellista hierarkiaa, mikä voisi auttaa sitä välttämään sotkeutumista.
”jos geenit ovat laitteisto, kromatiini on ohjelmisto”, Backman sanoo tiedotteessa. ”Jos kromatiinin rakenne muuttuu, se voi muuttaa genomiin tallennetun tiedon käsittelyä, mutta se ei muuta itse geenejä. Kromatiinin taittelun ymmärtäminen pitää sisällään avaimen siihen, miten solut erilaistuvat ja miten syöpä tapahtuu.”
K. Huang ym., ”Physical and data structure of 3D genome”, Sci Adv, doi: 10.1126 / sciadv.aay4055, 2020.
Emily Makowski on harjoittelijana The Scientistissä. Lähetä hänelle sähköpostia osoitteeseen [email protected].