Sarah Laskey, 23andMe Product Scientist
Kromosomimaalaus on yksi 23andMe-kokemuksen suosikkiosistani, koska se on täynnä tietoa. Toisaalta, se voi myös olla hieman pelottava, koska se näyttää niin paljon kaikki kerralla. Tässä blogikirjoituksessa käyn läpi joitakin perusasioita siitä, mitä Kromosomimaalauksessasi näkyy. Selitän, millaisia tarinoita se voi kertoa geneettisestä syntyperästäsi.
mikä on Kromosomimaalaus?
Kromosomimaalauksesi on toinen tapa tarkastella esi-isiesi Koostumustuloksia. Siinä on värikäs esitys 23 kromosomiparista, jotka muodostavat genomisi. Tässä on kuva siitä, miltä oikeat ihmisen kromosomit näyttävät mikroskoopin alla, vierekkäin Kromosomimaalaukseni kanssa:
vasemmalla olevassa mikroskoopin valokuvassa kromosomit asetetaan pystysuoraan. Oikealla olevassa Kromosomimaalauksessa ne näkyvät värikkäinä vaakapalkkeina. Molemmissa kuvissa kromosomit on esitetty pareittain ja merkitty numeroilla (1-22) tai kirjaimilla X ja Y.
Kromosomimaalauksessani on kaksi kopiota X-kromosomista, koska olen nainen. Kuvassa vasemmalla on biologisen miehen perimä, jolla on yksi kopio X-kromosomista ja yksi kopio Y-kromosomista. Y-kromosomeja ei näy Kromosomimaalauksissa.Kromosomin maalauksessa harmaat alueet kromosomeissa 13, 14, 15, 21 ja 22 edustavat genomin osia, joissa 23andMe ei testaa merkkiaineita, koska näiden alueiden DNA-sekvenssit ovat toistuvia ja vaikeasti mitattavissa.
tutkiessasi geeniperimääsi
Kromosomimaalauksessasi genomisi on ”maalattu” värein, jotka edustavat jopa 31: tä eri esi-isää. Voit leijua tai klikata Kromosomimaalauksesi eri esiäitejä oppiaksesi, mistä ne löytyvät genomistasi.31 esi-Isäpopulaatiota on järjestetty hierarkiaan, joka heijastaa globaalien populaatioiden geneettistä rakennetta. Esimerkiksi Britannia Ja Irlanti ovat osa Luoteis-Eurooppaa, joka on osa Eurooppaa. Nähdäksesi tämän hierarkian toiminnassa, katso tarkemmin Kromosomimaalaustani:
Kromosomimaalauksessani näkyy geneettisiä sukujuuria useista eri hienoresoluutioisista populaatioista, kuten brittiläisestä & irlantilaisesta, ranskalaisesta & saksalaisesta ja Aškenazijuutalaisesta. Mutta nämä kaikki ovat eurooppalaisen kielen alaluokkia. Kun napsautan oikealla puolella palkissa ”Eurooppalainen”, koko genomini on väritetty”Eurooppalainen sininen”:
mitä voit tehdä omalla korkearesoluutioisella kuvalla kunkin kromosomisi Kantakoostumuksesta? Voit klikata eri populaatioita ymmärtääksesi, miten ne liittyvät toisiinsa ja mistä ne löytyvät genomistasi. Voit myös keskustella perheenjäsenten (tai yhteyden heihin 23andMe)oppia, mitkä haarat perheesi mukana mitkä osat geneettisen syntyperän.
yksi segmentti, kaksi segmenttiä, punainen segmentti, sininen segmentti
Kromosomimaalauksesi värit kertovat esi-isiesi koostumuksesta, mutta voit oppia vielä enemmän tarkastelemalla kullekin esi-isälle osoitettujen DNA-segmenttien lukumäärää ja pituutta. Jokainen perii puolet DNA: staan äidiltään ja puolet isältään. Kun DNA siirtyy vanhemmilta heidän lapsilleen, kummankin parin kaksi kromosomia sekoitetaan sattumanvaraisesti toisiinsa rekombinaatioksi kutsutussa prosessissa.
tämä prosessi hajottaa yhden kantamuodon pitkät segmentit lyhyemmiksi lohkoiksi. Joskus rekombinaation aikana menetetään hyvin lyhyitä osia esi-isistä, eivätkä ne siirry seuraavalle sukupolvelle. Siksi kaukaisten esi-isiesi esi-isät näkyvät vain muutamassa lyhyessä osassa perimääsi, jos ollenkaan.Tekninen termi aiemmin erillisten populaatioiden geneettiselle sekoittumiselle on admixture. Jos kromosomin maalauksessa on eri värein maalattuja DNA-segmenttejä, ne ovat todisteita sekoittumisesta geenihistoriassasi. Katso näitä kahta Kromosomimaalausta vierekkäin:
näissä Kromosomimaalauksissa on hyvin erilaisia geenihistorioita, eikä pelkästään niiden syntyperän vuoksi! Vaikka emme huomioi värejä itse, kaksi kuvaa ovat melko erilaisia. Pitkät, katkeamattomat värijaksot vasemmalla ovat todiste viimeaikaisesta sekoittumisesta, kun taas eri esi-isien lyhyet segmentit oikealla viittaavat useiden sukupolvien sekoittumiseen. ago.My kromosomin maalaus on vasemmalla. Minulla on yksi isovanhempi, jonka perhe tuli Saksasta, yksi isovanhempi, jonka perhe tuli Irlannista, ja kaksi Ashkenazi Juutalainen isovanhemmat. Toisin sanoen esi-isäni eri eurooppalaisista populaatioista alkoivat juuri sekoittua toisiinsa kahden tai kolmen viime sukupolven aikana. T
hän kromosomi maalaus oikealla näkyy joku, joka tunnistaa Latino (Antonio, insinööri at 23andMe), jonka intiaani (keltainen), Afrikkalainen (vaaleanpunainen) ja eurooppalainen (sininen) esivanhemmat luultavasti alkoi sekoittua keskenään monta sukupolvea sitten.Miten voit käyttää tätä tietoa ymmärtääksesi omaa Kromosomimaalaustasi? Yleensä, jos viimeisin esi-isäsi populaatiosta oli hyvin tuore, sinulla on segmenttejä tuosta esivanhemmasta useammassa kromosomissa, ja nämä segmentit ovat pitempiä, kuin jos viimeisin esi-isäsi oli monta sukupolvea sitten.
Kiitos, äiti ja isä!
jos sinulla on biologinen vanhempi tai lapsi, joka on myös 23andMe-käyttäjä, voit ottaa heihin yhteyttä parantaaksesi esivanhempiesi Koostumustulosten erottelukykyä. Yhteys vanhempaan järjestää myös Kromosomimaalauksen uudelleen niin, että jokaisen parin ylin kromosomi on se, jonka perit äidiltäsi, ja alin kromosomi on se, jonka perit isältäsi.Vaikka et olisi yhteydessä kumpaankaan vanhempasi kautta 23andMe, saatat silti pystyä oppimaan hieman heidän syntyperä katsomalla Oman kromosomin maalaus:
- jos olet mies, perit kaikki X-kromosomiisi maalatut esi-isät äidiltäsi.
- jos kromosomin molempiin kopioihin on maalattu sama syntyperä, on peritty sama syntyperä kummaltakin vanhemmaltasi kyseiseltä perimän alueelta.
- jos sinulla on DNA: n osa DNA: n sukulaisen kanssa ja tiedät, onko sinulla yhteys kyseiseen sukulaiseen äidin-vai isänpuoleisella puolellasi, olet perinyt kyseisen DNA: n osan (ja sen syntyperän) samalta sukusi puolelta, jonka kautta olet yhteydessä kyseiseen sukulaiseen.
- jos vanhempasi tulevat erilaisista geneettisistä taustoista, voit ehkä arvata, mitkä kromosomit perit mistäkin vanhemmastasi. Voit tehdä tämän katsomalla esi-isiä, jotka on maalattu jokaiseen kromosomiin. Teknisistä syistä tämä toimii vielä paremmin, jos olet yhteydessä vanhempaan. Tämä johtuu siitä, että laskennallinen algoritmi pystyy vaiheittain raakatiedot tarkempi.
syvempi sukellus: Luottamustasot
jos olet oppinut Kromosomimaalauksen perustiedot ja haluat tutkia sitä vielä kehittyneemmällä tasolla, napsauta ”Muuta luottamustasoa” ja siirrä kromosomin maalauksen yläpuolella olevaa liukusäädintä. Voit tutkia Kromosomimaalauksesi erilaisia näkemyksiä eri luottamustasoilla. Voit myös vertailla eri näkemyksiä keskenään.
algoritmi, jolla laskemme esi-isienne koostumuksen, – analysoi pienen palan DNA: tanne kerrallaan. Jokaiselle DNA: si palalle laskemme sen todennäköisyyden, että se on peräisin 31 eri populaatiosta. Kromosomin maalauksen luottamusliitin antaa sinulle mahdollisuuden tutkia arviomme geneettisestä syntyperästäsi eri todennäköisyyksillä. Jos esimerkiksi DNA: si osalla on 55 prosentin mahdollisuus olla Japanilainen, niin se segmentti maalataan japanilaiseksi 50 prosentin luottamustasolla. Mutta 60-90 prosentin tasolla se maalataan laajemmalla syntyperällä (joko suurin piirtein Itäaasialainen, suurin piirtein Itäaasialainen & intiaani, tai nimetön).
kaiken kasaaminen
jokaisen geenihistoria on hieman erilainen. Jokaisella Kromosomimaalauksella on myös erilainen tarina kerrottavanaan. Tämä tarkoittaa, että saatat oppia enemmän syntyperä joitakin ehdotuksia tässä blogikirjoitus kuin muilta. Muista vain, että kuten kaikki todelliset taideteokset, Kromosomimaalaustasi ei voi ymmärtää. Sitä kannattaa tutkia.
saadaksesi yksityiskohtaisen teknisen selityksen siitä, miten laskemme syntyperäsi ja maalaamme kromosomisi, tutustu esivanhempien Koostumusoppaaseen.