päällekkäisiä restriktiofragmentteja kantavien kloonien vaiheittainen eristäminen siten, että ne kattavat kromosomin segmentin, joka on suurempi kuin faagissa tai kosmisessa vektorissa voidaan kuljettaa. Tekniikkaa tarvitaan yleensä sellaisen kiinnostavan lokuksen eristämiseen, jolle ei ole luotainta, mutta jonka tiedetään liittyvän tunnistettuun ja kloonattuun geeniin. Tätä luotainta käytetään genomikirjaston seulontaan. Tämän seurauksena kaikki merkkigeenin sisältävät fragmentit voidaan valita ja sekvensoida. Fragmentit ovat sitten linjassa, ja ne segmentit, jotka ovat kauimpana markkerigeenistä molempiin suuntiin, aliryhmitetään seuraavaa vaihetta varten. Näitä luotaimia käytetään genomikirjaston uudelleencreenaamiseen, jotta voidaan valita uusia päällekkäisten sekvenssien kokoelmia. Prosessin toistuessa yhä kauemmas merkkigeenistä etääntyvien alueiden nukleotidisekvenssit tunnistetaan, ja lopulta kohdataan kiinnostava lokus. Jos on olemassa kromosomipoikkeama, joka siirtää tietyn molekyylimarkkerina toimivan geenin toiseen asentoon kromosomissa tai toiseen kromosomiin, kromosomikävely voidaan siirtää toiseen asentoon genomissa. Kromosomipoikkeavuuksien käyttöä tämäntyyppisissä kokeissa kutsutaan kromosomihyppelyksi. Katso Chronology, 1978, Bender, Spierer, and Hogness.