spatiaalinen paikannus on ydinprosesseja ohjaava perusperiaate. Kromatiini on järjestäytynyt hierarkiana nukleosomeista Mbp-kromatiinidomeeneihin (CD) tai topologisesti assosioiviin domeeneihin (Tad) korkeamman tason lokeroihin, jotka huipentuvat kromosomin alueisiin (CT). Mikroskooppi-ja sekvensointitekniikat ovat osoittaneet kromatiinin järjestäytymisen kriittiseksi geenien ilmentymistä sääteleväksi tekijäksi. Esimerkiksi tehostajat loop takaisin vuorovaikutuksessa niiden kohdegeenien lähes yksinomaan tad, distaalisesti sijoitettu coregulated geenit uudelleen yhteisiin transkriptio tehtaita aktivoinnin jälkeen, ja Mbp CDs näyttely dynaaminen liike ja konfiguraatio muutoksia in vivo. Pitkäaikainen kysymys ydinkentässä on, tarjoaako interaktiivinen ydinmatriisi suoran yhteyden rakenteen ja toiminnan välille. Havainnot CT: n nonrandom radial-sijoittumisesta tumaan viittaavat siihen, että TT-populaatioilla voi olla etuoikeutettuja vuorovaikutusmalleja. Peräkkäiset merkinnät 10 CT: hen asti, joita seurasi tietokonekuvantamisen ja geometrisen graafin louhinta-algoritmien soveltaminen, paljastivat CT: n solutyyppikohtaiset interkromosomaaliset verkot (ICN), joita muutetaan solusyklin, erilaistumisen ja syövän etenemisen aikana. ICN: n ehdotetaan korreloivan genomisäätelyn globaalin tason kanssa. Nämä lähestymistavat osoittivat myös, että CT: n suuren mittakaavan 3‐D-topologia on spesifinen kullekin CT: lle. Se, että normaaleissa soluissa tietyt kromosomialueet ovat solutyyppikohtaisesti lähellä toisiaan, voi selittää syöpätyyppien eri translokaatioiden taipumuksen. Sen ymmärtäminen, miten geenit häiriintyvät, kun tuman normaali ”johdotus” häiriintyy syövän tunnusmerkkeihin kuuluvilla translokaatioilla, poistoilla ja vahvistuksilla, pitäisi mahdollistaa kohdennetummat hoitostrategiat.