Yhdysvalloissa Food and Drug Administration vaatii säännöllistä verenkuvan seurantaa kaikilta klotsapiinia saavilta potilailta. Klotsapiinin melko harvinainen mutta vakava haittavaikutus on vaikea neutropenia, jonka absoluuttinen neutrofiilimäärä (ANC) on alle 500/µL. Neutrofiilit ovat valkosolutyyppi, joka torjuu infektioita. Vaarallisin neutropenian muoto on agranulosytoosi, jota esiintyy enintään 1%: lla klotsapiinia käyttävistä potilaista, tavallisimmin 6-18 viikkoa lääkityksen aloittamisen jälkeen. Agranulosytoosi on yleensä äkillinen ANC: n lasku nollaan, sen arvellaan olevan autoimmuunisairaus, ei pysyvä, ei liity annokseen ja on lääketieteellinen hätätapaus. Vakava neutropenia voi olla hengenvaarallinen, jos sitä ei havaita ja hoideta, koska se altistaa infektioille. Vaaditulla seurannalla klotsapiini on turvallinen ja neutropeniasta johtuvat kuolemantapaukset ovat hyvin harvinaisia. Klotsapiinin määräämiseksi sairaalan ulkopuolella lääkärin tulee ilmoittautua kansalliseen klotsapiini REMS-ohjelmaan numerolla https://www.clozapinerems.com, suorittaa koulutus ja läpäistä tietokilpailu. Tämä kestää yleensä alle tunnin. Klotsapiinia saadakseen potilaiden tulee olla osa järjestelmää, johon kuuluu säännöllinen ANC-seuranta ja neutrofiilien määrän raportointi REMS-rekisterissä. Klotsapiinia aloitettaessa ANC mitataan joka viikko 6 kuukauden ajan, sitten joka toinen viikko 6 kuukauden ajan ja sitten kuukausittain, jos kaikki ANC-tulokset ovat riittävät. Seurantaa tai hoitoa muutetaan, kun ANC on alle 1500/µL. Seurantaprotokolla, mukaan lukien miten ja milloin reagoidaan alhaisiin ANC-tuloksiin, on https://www.clozapinerems.com/cpmgclozapineui/rems/pdf/resources/ANC_Table.pdf . Kun potilaiden ANC-arvot eivät ole vaarallisia, mutta lähellä seurantakynnystä, laboratorioita arvotaan joskus myöhemmin päivällä, jolloin valkosolujen määrä voi olla korkeampi. On olemassa erilainen seurantaprotokolla potilaille, joilla on diagnosoitu hyvänlaatuinen Etninen Neutropenia (BEN). BEN on yleisempi tietyissä etnisissä ryhmissä, erityisesti Afrikkalaistaustaisissa. Ihmisillä, joilla on BEN, on turvalliset, normaalit ANC: t, jotka ovat alempia kuin tavalliset referenssialueet.