B-ja T-lymfosyyteiltä testataan niiden affiniteetti itse-MHC/peptidikomplekseihin ennen kuin ne poistuvat primaarisista lymfoidielimistä ja siirtyvät periferiaan. Jos niillä on suuri affiniteetti itseantigeeniin, yksi keino estää autoimmunity on kloonisen deleetion kautta. Tällöin lymfosyytti vastaanottaisi apoptoottisia signaaleja antigeenia esittelevästä solusta (APCs). On tärkeää huomata, että kaikki lymfosyytit, jotka ilmentävät suurta affiniteettia itse-antigeeniin, eivät kärsi kloonisesta deleetiosta. B-lymfosyytit voivat myös osallistua kevyen ketjureseptorin muokkaukseen, VH-geenien korvaamiseen tai vapautua ja myöhemmin käydä läpi negatiivisen valinnan periferiassa. T-lymfosyytit voivat sen sijaan suorittaa kloonisen pidätyksen, kloonisen anergian ja kloonisen muokkauksen. Jos autoreaktiiviset solut välttyvät klooniselta deleetiolta joko kateenkorvassa tai luuytimessä, periferiassa on mekanismeja, joihin liittyy t-säätelysoluja, jotka estävät isäntää saamasta autoimmuunisairautta. Primaaristen lymfoidisten elinten B-ja T-soluissa klooninen deleetio on kuitenkin yleisin negatiivisen valinnan muoto.
B-solut
B-solut, joilla on suuri affiniteetti itsesoluihin, voivat läpikäydä kloonisen deleetion luuytimessä. Tämä tapahtuu sen jälkeen, kun funktionaalinen B-solureseptori (BCR) on koottu. On mahdollista, että B-solut, joilla on korkea itsensä affiniteetti, jäävät vaille suojaa, koska ne vaativat aktivointisignaaleja ja stimulaatiota autoreaktiivisilta T-soluilta. Tällaiset T-solut poistetaan usein kloonisella deleetiolla, jolloin autoreaktiiviset B-solut jäävät stimuloimatta ja aktivoimatta. Nämä B-solut eivät muodosta uhkaa edes periferiassa, koska niitä ei voi aktivoida ilman autoreaktiivista T-solua stimuloimaan niitä.
T-solujen määrä
2-5% T-soluista kehittää autoreaktiivisia reseptoreita. Useimmat näistä käyvät läpi negatiivisen valinnan kloonisella poistolla.
Kateenkortexedit
T-solut, joilla on suuri affiniteetti itse-MHC/peptidikomplekseihin, voivat läpikäydä kloonisen deleetion kateenkorvassa. Kateenkorvan dendriittisolut ja makrofagit näyttävät olevan vastuussa kateenkorvan autoreaktiivisiin T-soluihin lähetettävistä apoptoottisista signaaleista.
kateenkorvan ytimen
T-soluilla on myös mahdollisuus tehdä klooninen deleetio kateenkorvan ytimessä, jos niillä on suuri affiniteetti itse-MHC/peptidikomplekseihin. Positiivinen valinta tapahtuu kateenkorteksissa, mikä viittaa siihen, että on mahdollista, että solu käy läpi positiivisen valinnan aivokuoren sisällä ja sitten negatiivisen valinnan ydinkuoressa kloonisen deleetion kautta. Epiteelisolut ovat vastuussa kloonisen deleetion sisällä ydin. Nämä medullaariset epiteelisolut ilmentävät autoimmuunisäätelijää (AIRE), jonka avulla nämä solut esittävät t-lymfosyyteille ominaisia proteiineja muille kehon osille. Tämä auttaa poistamaan autoreaktiiviset T-solut, jotka tunnistavat proteiinin tietystä ruumiinosasta.