kirjahylly

useimmin raportoitu sukupuolitauti Yhdysvalloissa on Loisbakteeri Chlamydia trachomatis. Vaikka tartuntoja raportoidaan vuosittain noin puoli miljoonaa, realistisempi esiintyvyys on noin 4 miljoonaa tapausta vuodessa. Tämä johtuu siitä, että populaatiossa on paljon oireettomia yksilöitä. Hoitamattomana klamydiainfektiot voivat kehittyä sisäsynnytintulehdukseksi (PID) ja voivat aiheuttaa myös vaikean, mutta parannettavissa olevan silmäsairauden (trakooman).

Chlamydia Genome Project consortium on äskettäin sekvensoinut C. trachomatis-genomin. Sen kehäkromosomi on noin 1 045 000 emäsparia, noin neljännes Escherichia coli-bakteerin koosta. Sekvenssin analyysissä on tunnistettu 888 proteiinia koodaavaa geeniä. Näistä joillakin proteiineilla näyttää olevan epätavanomainen luonnonhistoria.

perimä näyttää läpikäyneen poikkeuksellisen paljon horisontaalisia geeninsiirtotapahtumia, mikä viittaa siihen, että C. trachomatis-bakteerin loisluonne tarjoaa suuremman mahdollisuuden geeninsiirtoon. Omituisempaa on kuitenkin se, että osa C: stä. trachomatis-proteiinit ovat enemmän sukua viherkasveille kuin muille bakteereille tai niiden ihmisisännille.

FabI ja FabF, kaksi kalvobiogeneesin rasvahapposynteesiin osallistuvaa klamydiaproteiinia, näyttävät olevan läheisintä sukua kasvikumppaneilleen, kun taas lipopolysakkaridien biosynteesiin osallistuvalla plsB: llä on vain kasviortologeja.

miten tämä sai alkunsa kahden tiedon yhdistämisestä. Ensinnäkin klamydian kaltainen loinen on äskettäin löydetty Acanthamoebasta, vapaasti elävästä alkueläimestä, jota tavataan yleensä makeassa vedessä tai maaperässä, mutta joka voi esiintyä ihmisen taudinaiheuttajana. Ehkä Acanthamoeba edustaa klamydian alkuperäistä isäntää ja toimi vektorina klamydian loisen siirtämiseksi ihmisiin. Toiseksi 16S: n kaltaisesta RNA: sta tehdyt päätelmät todistavat, että Acanthamoeba on fylogeneettisesti sukua viherkasveille. Voisi siis olettaa, että jotkin Akanthameebat ja viherkasvien geenit ovat hyvin sukua toisilleen. Vaakasuora siirto acanthamoeban (isäntä) ja klamydian (loinen) välillä voisi siis antaa klamydialle kasvimaisia geenejä. Jos tämä horisontaalinen siirto tapahtui ennen klamydian siirtymistä ihmisiin, on mahdollista, että ihmisen loisella on kasvimaisia geenejä.

klamydian perimän analysointi antaa lähtökohdan muiden eukaryoottisten loisten, myös ihmisten sairauksien aiheuttajien, syvemmälle ymmärtämiselle.