muuttuva ilmasto voi purkaa ekosysteemejä, joissa eri eliöt käyttävät erilaisia sisäisiä kalentereita. Lämpeneminen voi johtaa kasviston varhaisempiin kukintoihin keväällä. Esimerkiksi yksi tutkimus suorittaa Menzel et al., analysoi 125000 fenologista kirjaa 542 kasvilajista 21: ssä Euroopan maassa vuosina 1971-2000 ja havaitsi, että 78% kaikista tutkituista kasveista edistyi kukinnossa, lehtien levityksessä ja hedelmäsateessa, kun taas vain kolme prosenttia viivästyi merkittävästi. He määrittivät, että kevään ja kesän keskimääräinen eteneminen oli Euroopassa 2,5 päivää vuosikymmenessä. Samaan aikaan eläimistö saattaa lisääntyä tai muuttaa päivän pituuden perusteella, ja näin ollen saattaa saapua liian myöhään kriittiselle ravinnonsaannille, jonka kanssa ne ovat yhdessä kehittyneet.
esimerkiksi Parus major ajoittaa poikastensa kuoriutumisen tarkasti valkuaispitoisen talvehtijan toukan syntymiseen, joka puolestaan kuoriutuu kohtaamaan tammien orastuksen. Nämä linnut ovat yksikotinen lintu, eli ne pesivät kerran vuodessa noin yhdeksän poikasta per poikue. Jos linnut ja toukat ja silmut tulevat esiin oikeaan aikaan, toukat syövät uudet tammenlehdet ja niiden populaatio kasvaa dramaattisesti, ja tämä toivottavasti osuu samaan aikaan uusien poikasten saapumisen kanssa, jolloin ne voivat syödä. Mutta jos kasvit, hyönteiset ja linnut reagoivat eri tavalla kevään etenemiseen tai muihin fenologian muutoksiin, suhde voi muuttua.
toisena esimerkkinä Pihtiputaalla (ficedula hypoleuca) tehdyt tutkimukset ovat osoittaneet, että niiden kevätmuuton ajoituksen laukaisee sisäinen ympärivuotinen kello, joka on hienosäädetty päivän pituuteen. Nämä nimenomaiset linnut talvehtivat kuivissa trooppisissa metsissä Länsi-Afrikassa ja pesivät Euroopan lauhkeissa metsissä yli 4 500 kilometrin päässä. Vuosina 1980-2000 saapumisajan ja pesinnän alun lämpötilat ovat lämmenneet merkittävästi. Ne ovat aikaistaneet keskimääräistä munintapäiväänsä kymmenellä päivällä, mutta eivät ole aikaistaneet kevään saapumista pesimäalueilleen, koska niiden muuttokäyttäytymisen laukaisee lämpötilan sijaan valoperiodi.
lyhyesti sanottuna, vaikka jokainen yksittäinen laji voi helposti elää korkeissa lämpötiloissa, fenologisen ajoituksen häiriöt ekosysteemitasolla voivat silti vaarantaa ne.