lähetä…
A. by ”cut and paste”: (i) a single sequence in FASTA format or onlyplain sequence, or (ii) multiple sequences in FASTA format.
B. A-tiedosto FASTA-muodossa. Kirjoita tiedoston polku suoraan tai käytä ”Selaa” – painiketta löytääksesi tiedostosi.
huomautus: Klorop hyväksyy vain aminohapposekvenssejä.
Sisältää N-terminaalin
on erittäin suositeltavaa sisällyttää n-terminus toimitettuun jaksoon.Mitä kauempana n-terminaalisesta jäännöksestä esitetty sekvenssi alkaa, sitä hankalampi ja epäluotettavampi ennuste on.
lähetä mieluiten noin 100 jäämää
lähetä mahdollisuuksien mukaan noin 100 N-terminaalista jäämää. Ehdotettu pituus johtuu siitä, että ”cTP”/”no CTP” – ennustaja koulutettiin syöttösekvensseillä, joiden pituus on 100 jäämää. Lyhyemmät sekvenssit voivat kuitenkin olla myös tyydyttäviä (on tärkeämpää, että N-terminaalinen osa on ehjä). Slavage-sivuston ennustaminen rajoittuu mahdollisen pilkkoutumispaikan etsimiseen 100: sta N-terminaalisimmasta jäännöksestä, eikä siihen sinänsä vaikuta seurauspituus.
sekvenssien nimet
sekvenssien nimet voivat olla minkä pituisia tahansa, mutta vain ensimmäiset 20karakteria säilytetään koko ennustuksessa ja esitetään chlorop predictionin tulossivulla.
Detailed output
rasti tähän ruutuun, jos haluat, että neuroverkkoarvosana esitetään myös jokaiselle jaksolle (eikä vain jokaiselle jaksolle).Lisäksi esitetään verkkopisteiden derivaatta, jota käytetään etsittäessä aluetta, jolta sivujäämä sijaitsee (40 jäännöstä, joilla on korkein derivaattapistemäärä), sekä kunkin jäämän pilkkominen sitescore (CS-score).