kromosomaalinen DNA-replikaatio edellyttää, että DNA-polymeraasit kytketään renkaanmuotoisiin liukukiinnikkeisiin, jotka ympäröivät DNA: ta ja mahdollistavat nopean, processiivisen replikaation. Liukukiinnikkeet Ladataan DNA: han clamp loader-kompleksilla, joka on pentamerikaalinen yhdistelmä atpaasien AAA+ – perheeseen kuuluvia proteiineja.
haluamme ymmärtää pihtikuormaajien toimintaa ja mekanismia atomisesti yksityiskohtaisesti. Viimeaikaiset rakenteet T4 bacteriophage clamp loader monimutkainen primer-malli DNA ja liukuva clamp ovat ehdottaneet toimiva malli clamp loader mekanismi alla (KS. Kelch et al Science 2011):
mallimme ennustaa, että ATP: n hydrolyysi alkaa AAA+ – spiraalin päästä ja etenee peräkkäin spiraalia ylöspäin, mikä johtaa puristinkuormaajan ulosvetoon DNA: sta ja suljetusta puristimesta. Hypoteesimme näkyy tässä animaatiossa kolmesta peräkkäisestä ATP: n hydrolyysitapahtumasta:
testaamme näitä clamp loader mekanismin malleja käyttäen monenlaisia biokemiallisia, biofysikaalisia ja rakenteellisia menetelmiä. Clamp loader-mekanismin ymmärtäminen atomin yksityiskohtaisesti vaikuttaa merkittävästi DNA: n replikaation ymmärtämiseen sekä siihen liittyvien AAA+ – proteiinikokoonpanojen mekanismiin. Viime kädessä ennakoimme mekanistisen ymmärryksemme avulla kehittävämme uusia nanolaitteita ja AAA+ – funktion pienimolekyylisiä efektoreita.