CodonCode Aligner – DNA Sequence Assembly ja linjaus Windows ja Mac OS X

CodonCode Aligner on ohjelma sekvenssin kokoonpanoon, contig editointiin ja mutaatioiden havaitsemiseen, saatavilla Windowsille ja Mac OS X: lle. Aligner on yhteensopiva Phred-Phrap: n kanssa ja tukee täysin sekvenssin laatupisteitä, mutta tarjoaa tutun, helposti opittavan käyttöliittymän, kuten seuraavat kuvakaappaukset osoittavat.:

Contig Overview linjaus puun kanssa  Erotaulukko Jälkinäkymät ja Rajoituskartta

Lataa CodonCode Aligner

CodonCode Aligner hinnat ja tilaustiedot

osta

kanssa CodonCode Aligner, voit:

  • tuo sekvenssejä tekstitiedostoista
  • tuo sekvenssejä ABI -, SCF – ja FASTQ-tiedostoista
  • Päätykiinnike
  • Vektoritrimmi
  • kokoa kontigit
  • tasaa vertailusekvenssiin
  • kohdista contigs toisiinsa pitäen linkkejä jälkiä
  • koota tai kohdistaa ryhmissä, perustuu näyte nimet
  • Etsi heterotsygoottisia mutaatioita
  • analysoi heterotsygoottiset lisäykset ja poistot
  • määrittele kiinnostavat alueet (”ominaisuudet”), esimerkiksi heikkolaatuiset konsensusalueet
  • siirry nopeasti käyttäjän määrittelemien ominaisuuksien välillä
  • luo fylogeneettisiä puita ja rajoituskarttoja
  • Suorita Phred ja Phrap suoraan Aligner-projekteista
  • vie sekvenssit ja ominaisuudet
  • Katso erotaulukot ja proteiinikäännökset
  • Design-pohjamaalit
  • kokoa bakteerien genomeja ja pieniä NGS-sekvensointiprojekteja
  • Etsi entsyymejä RFLP-analyysiin & luo virtuaaligeeli
  • analysoi metyloidut sekvenssit & Näytä raw trace data

CodonCode Aligner voit hyödyntää täysimääräisesti nykyaikaiset algoritmit base calling ja sekvenssi assembly, pakottamatta sinua oppimaan monimutkaisia komentoriviasetukset tai Perl ohjelmointi.

Kiinnostaako? Mene eteenpäin ja lataa demo versio CodonCode Aligner. Demoversio on täysin toimiva trace viewer ja editor. Ensikertalaiset saavat automaattisen 30 päivän kokeiluversion, jonka avulla voit kokeilla kaikkia toimintoja CodonCode Alignerissa.

lataamisen jälkeen suosittelemme, että katsot esittelyvideon tutustuaksesi Alignerin tärkeimpiin ominaisuuksiin.

me toisinaan annamme alennettuja lisenssejä CodonCode Alignerin rekisteröityneille faneille Facebookiin – tarkista Facebook CodonCode Aligner lisätietoja!

CodonCode Aligner Facebookilla

Vastaa

Sähköpostiosoitettasi ei julkaista.