vuonna 1949 Kluckhohn alkoi työskennellä viidessä vierekkäisessä lounaisyhteisössä: Zuni, Navajo, mormoni (LDS), espanjalais-amerikkalainen (meksikolais-amerikkalainen) ja teksasilainen Homesteaders keskeinen metodologinen lähestymistapa, jonka hän kehitti yhdessä vaimonsa Florence Rockwood Kluckhohnin ja kollegoidensa Evon Z. Vogtin ja Ethel M. Albertin kanssa, oli Arvosuuntautumisteoria. He uskoivat, että kulttuurien välistä ymmärrystä ja viestintää voitaisiin helpottaa analysoimalla tietyn kulttuurin suuntautumista ihmiselämän viiteen keskeiseen osa-alueeseen: Ihmisluonto (ihmiset, joita pidetään luontaisesti hyvinä, pahoina tai sekoittuneina); ihmisen ja luonnon välinen suhde (näkemys, jonka mukaan ihmisen tulisi olla alisteinen luonnolle, dominoida luontoa tai elää sopusoinnussa luonnon kanssa); aika (ensisijainen arvo asetettu menneisyydelle/perinteelle, nykyisyydelle/nautinnolle tai tulevalle/jälkipolville/viivästyneelle tyydytykselle); toiminta (oleminen, tuleminen/sisäinen kehitys tai tekeminen/ponnistelu/uutteruus); ja sosiaaliset suhteet (hierarkkinen, sivullinen/kollektiivinen-egalitaarinen tai individualistinen). Arvosuuntautumismenetelmän kehittivät pisimmälle Florence Kluckhohn kollegoineen ja opiskelijoineen myöhempinä vuosina.
Kluckhohn sai monia kunnianosoituksia koko uransa ajan. Vuonna 1947 hän toimi American Anthropological Associationin puheenjohtajana ja hänestä tuli Venäjän tutkimuskeskuksen ensimmäinen johtaja Harvardissa. Samana vuonna hänen kirjansa Mirror For Man voitti McGraw Hill-palkinnon parhaasta suositusta tieteeseen liittyvästä kirjoituksesta.
Kluckhohn uskoi aluksi rotujen biologiseen tasa-arvoon, mutta käänsi myöhemmin kantansa. Kluckhohn kirjoitti vuonna 1959, että ”kun otetaan huomioon, että kartoitettujen geenien esiintyvyys vaihtelee merkittävästi eri kansojen välillä, näyttää epäviisaalta otaksua suoraan, että ’ihmisen luontainen kapasiteetti ei vaihtele populaatiosta toiseen’…. Olettaen, että kunkin geenipoolin ominaisuudet vaikuttavat tiettyihin kapasiteetteihin, vaikuttaa hyvin todennäköiseltä, että populaatiot eroavat kvantitatiivisesti mahdollisuuksissaan tietyn tyyppisiin saavutuksiin.”
Clyde Kluckhohn kuoli sydänkohtaukseen mökissä Pecosjoen yläjuoksulla lähellä Santa Feä New Mexicossa. Hän jäi eloon vaimonsa, tohtori Florence Rockwood Kluckhohnin kanssa, joka myös opetti antropologiaa Harvardin yhteiskuntasuhteiden laitoksella. Clyde Kluckhohn jäi eloon myös hänen poikansa Richard Kluckhohn. Suurin osa hänen papereistaan pidetään Harvardin yliopistossa, mutta joitakin varhaisia käsikirjoituksia säilytetään Iowan yliopistossa.