Abstrakti
Myelooiset solut ovat tärkeitä ihmisen sytomegaloviruksen (CMV) aiheuttaman lyyttisen ja piilevän infektion alueita. Osoitimme aiemmin, että vain pieni osa CD34+ – hematopoieettisista kantasoluista erotetuista myelooisista soluista sallii CMV: n replikaation, mikä korostaa näiden populaatioiden heterogeenisuutta. Herkkien ja vastustuskykyisten solutyyppien tarkkaa tunnistettavuutta ja salliville soluille tyypillisiä solutyyppejä ei kuitenkaan voitu dissektoida käyttäen keskiarvoa kuvaavia transkriptioanalyysityökaluja, kuten mikroarakeita, ja näin ollen ne pysyivät arvoituksellisina. Tässä profiloimme 7000 yksittäisen solun transkriptomit ensimmäisenä päivänä tartunnan jälkeen käyttäen 10x genomics-alustaa. Osoitamme, että virus-transkriptit ovat havaittavissa useimmissa soluissa, mikä viittaa siihen, että virionin tulo ei todennäköisesti ole solujen rajoitusmekanismien pääkohde. Lisäksi osoitamme, että viruksen replikaatio tapahtuu pienessä mutta erityisessä soluryhmässä, joka on transkriptioiden mukaan sukua ja todennäköisesti peräisin Soluryhmästä, joka ilmaisee Pesäkkeenmuodostusyksikön markkereita-Granulosyyttiä, erytrosyyttiä, Monosyyttiä, Megakaryosyyttiä (PMY – GEMM). Muuhun väestöön verrattuna PMY-GEMM-solut rikastuvat transkripteissä mitokondrioiden energiantuotannossa, solujen proliferaatiossa, RNA: n prosessoinnissa ja proteiinisynteesissä, ja ilmentävät yhtä suuria tai suurempia määriä interferoniin liittyviä geenejä. Vaikka edellisen ilmentymistasot säilyvät infektoituneissa soluissa, jälkimmäiset ovat voimakkaasti alas säädeltyjä. Ehdotamme näin ollen, että pmy-GEMM-solujen ensisijainen tartunta voi johtua ennalta vahvistetusta virusmyönteisestä ympäristöstä, joka vaatii viruksen efektoreilta minimaalisia optimointipyrkimyksiä, eikä erityisten rajoitustekijöiden puuttumisesta. Yhdessä nämä löydökset tunnistavat mahdollisesti uuden myelooisten solujen populaation, joka on altis CMV: n replikaatiolle, ja tarjoavat mahdollisen perusteen sille, että niiden infektio on ensisijainen.
tekijän Yhteenveto MYELOOISET solut, kuten monosyytit ja dendriittisolut, ovat CMV-infektion kriittisiä kohteita. Tunnistaaksemme solutekijät, jotka antavat alttiuden tai vastustuskyvyn infektiolle, profiloimme ∼ 7000 yksittäisen solun transkriptomit PUOLILÄPÄISEVISTÄ MYELOOISISTA soluista, jotka ovat infektoituneet CMV: llä. Havaitsimme, että virusperäiset RNA: t ovat havaittavissa useimmissa soluissa, mutta CMV-lyytisten geenien huomattava ilmentyminen tapahtuu vain pienessä solujoukossa, joka on transkriptioiden osalta sukua pmy-GEMM-progenitoriryhmälle, joka ilmaisee saman määrän transkriptioita, jotka koodaavat interferoniin liittyviä anti-virustekijöitä kuin muu väestö, mutta korkeammat transkriptiot, jotka koodaavat proteiineja, joita tarvitaan energian, RNA: n ja proteiinin tuotantoon. Päättelemme näin ollen, että pmy-GEMM-solujen ensisijainen infektio saattaa johtua ennestään solunsisäisestä ympäristöstä, joka edistää infektion puhkeamista, eikä siitä, että virukseen pääsyä tai geenien alkuperäistä ilmentymistä rajoittavia anti-virus-tekijöitä ei ole. Yhdessä nämä löydökset paljastavat uudentyyppisiä MYELOOISIA soluja, jotka mahdollisesti sallivat CMV-infektion, laajentavat ymmärrystämme SOLUVAATIMUKSISTA CMV-infektion menestyksekkäälle aloittamiselle ja tarjoavat uusia pro – ja anti-virus-geenikandidaatteja tulevia analyyseja ja hoitotoimenpiteitä varten.