Berthold Hatschek (3 de abril de 1854 – 18 de enero de 1941) fue un zoólogo austriaco recordado por sus estudios embriológicos y morfológicos de invertebrados.
estudió zoología en Viena, bajo Carl Claus (1835-1899), y en Leipzig con Rudolf Leuckart (1822-1898). Obtuvo su doctorado en la Universidad de Leipzig con una disertación titulada Beiträge zur Entwicklungsgeschichte der Lepidopteren. Hatschek fue profundamente influenciado por las obras de Ernst Haeckel (1834-1919).
En 1885 fue nombrado profesor de zoología en la Universidad Carolina de Praga, y desde 1896 fue profesor y director del segundo instituto zoológico de la Universidad de Viena. Hatschek sufrió una depresión severa, que afectó en gran medida su trabajo en las últimas etapas de su vida.
Hatschek es recordado por la llamada «teoría del trocóforo», en la que explica que el trocóforo es la forma larvaria de un organismo hipotético, el «trochozoon» (que en forma adulta correspondía a un rotífero similar al trocóforo, y era el ancestro común sugerido de casi todas las formas de vida metazoanas bilaterales).
En 1888 dividió la Coelenterata de Frey y Leuckart en tres filos: Spongiaria, Cnidaria y Ctenophora. De su investigación de los anfioxos, se derivan los términos anatómicos «Hoyo de Hatschek» y «nefridium de Hatschek».