CI-MS is een massaspectroscopische techniek waarbij de analyt reageert met ionen van een reagensgas.In de gewone elektronenionisatiemassaspectrometrie, EI-MS, wordt de analyt gebombardeerd met energetische elektronen om ionen te produceren. De energetische ionen breken af in vele fragmentatieproducten.
in de massaspectrometrie van de chemische ionisatie bevindt de analyt zich in een grote overmaat van een reagensgas, zoals methaan, ammoniak of isobutaan.
de elektronenbundel ioniseert het reagensgas bij voorkeur. Botsingen met andere reagensgasmoleculen creëren een ionisatieplasma.
het plasma reageert vervolgens met de analyt om positieve en negatieve ionen te vormen.
CI is een lager energetisch proces dan EI. Het levert vaak minder fragmentatie en een eenvoudiger spectrum op. Een CI spectrum heeft meestal een gemakkelijk identificeerbare moleculaire ion.
wanneer u massaspectra analyseert, identificeert u eerst de moleculaire ionen. Dan is het vrij gemakkelijk om de fragmenten te identificeren.
bij EI kunnen er geen moleculaire ionen zijn of kunnen ze te zwak zijn om te bevestigen.
daarentegen is CI een zachtere ionisatiemethode dan EI. Fragmentatie is minder waarschijnlijk, dus de moleculaire ionen zijn meer prominent.
suikers kunnen bijvoorbeeld meer vluchtig worden gemaakt door hun OH-groepen om te zetten in trimethylsilyl (TMS) – ethers.
ROH + (CH₃)₃SiCl → RO-Si (CH₃)₃
Sucrose heeft 8 OH groepen.
het vormt een octa-TMS ether met moleculaire formule C₃₆hoosisi₈.
het EI-spectrum vertoont geen detecteerbaar moleculair ion.
in tegenstelling, vertoont het CI spectrum met ammoniak als reagensgas een prominent moleculair ion (M+NH₄)⁺.