het bewijs dat langdurige toediening van relatief lage doses clonidine de respons van bloedvaten op vasodilaterende en vasoconstrictieve geneesmiddelen bij dieren verminderde, leidde tot het onderzoek naar de preventie van migraine bij de mens. De resultaten van placebogecontroleerde en open therapeutische studies hebben aangetoond dat clonidine in lage dosering (75 tot 150 mok per dag) nuttig is bij het voorkomen van migraine bij ongeveer 30% -50% van de patiënten. Bij 40% van de patiënten in gecontroleerde en open studies is een vermindering van de frequentie van hoofdpijn of van de hoofdpijn-indices met 50% of meer gemeld. Dus clonidine, net als andere geneesmiddelen die worden gebruikt in de intervaltherapie van migraine, kan worden verwacht effectief te zijn in slechts een deel van de patiënten. Hoewel clonidine niet direct is vergeleken met andere geneesmiddelen die worden gebruikt bij de profylactische behandeling van migraine, is de algemene klinische indruk dat het minder effectief is dan pizotifen of methysergide. Omdat het relatief goed wordt verdragen bij doseringen van 75 tot 150 mok per dag is het waardig van een proef, met name bij patiënten geacht profylactische migraine therapie voor de eerste keer nodig, en wanneer migraine optreedt in combinatie met hypertensie. Bij de doseringen gebruikt bij migraine profylaxe, die bijna altijd lager zijn dan gebruikt bij hypertensie, veroorzaakt clonidine geen hypotensie en kan worden gebruikt bij patiënten met hart-en vaatziekten. De belangrijkste bijwerkingen zijn slaperigheid en een droge mond, die de neiging hebben af te nemen naarmate de behandeling wordt voortgezet.