상대적으로 낮은 용량의 클로니딘을 장기간 투여하면 동물의 혈관 확장제 및 혈관 수축 약물에 대한 혈관의 반응성이 감소한다는 데모는 사람의 편두통 예방에 대한 조사로 이어졌다. 위약 대조 및 개방형 치료 시험의 결과는 저용량(매일 75~150 머그잔)의 클로니딘이 환자의 약 30%-50%에서 편두통 예방에 유용하다는 것을 보여주었습니다. 두통 빈도 두통 색인에 있는 50%또는 더 중대한 감소는 통제되는 열리는 학문에 있는 환자의 40%에서 보고되었습니다. 따라서 편두통의 간격 치료에 사용되는 다른 약물과 마찬가지로 클로니딘은 환자의 일부에서만 효과적 일 것으로 예상 할 수 있습니다. 클로니딘이 편두통의 예방 치료에 사용되는 다른 약물과 직접 비교되지는 않았지만,일반적인 임상 적 인상은 피조 티펜 또는 메티 세르 기드보다 덜 효과적이라는 것입니다. 그것은 75~150 찻잔 매일 복용량에 상대적으로 잘 허용 하기 때문에 그것은 특히 예방 편두통 치료를 필요로 하는 것으로 간주 하는 환자에서 재판의 가치가 처음으로,그리고 편두통 고혈압과 연관 하 여 발생 하는 경우. 고혈압에 사용되는 것보다 거의 변함없이 낮은 편두통 예방에 사용되는 용량에서 클로니딘은 저혈압을 유발하지 않으며 심혈관 질환 환자에게 사용될 수 있습니다. 주요한 부작용은 처리가 계속하는 때 점감해 경향이 있는 구강 건조증과 기면상태 입니다.