a kettős rekombináns osztályok kimutatása azt mutatja, hogy kettős keresztezésnek kell bekövetkeznie.Ennek ismeretében megkérdezhetjük, hogy a szomszédos kromoszómarégiók kereszteződései függetlenek-e, vagy az egyik régióban a keresztezés befolyásolja-e annak valószínűségét, hogy egy szomszédos régióban kereszteződés van. Kiderül, hogy gyakran nem függetlenek: az interakciót interferenciának nevezik.
az elemzés a következő módon közelíthető meg. Ha a két régió kereszteződései vannakfüggetlenek, akkor a termékszabály szerint (lásd a 37.oldalt) a kettős kombinánsok gyakorisága megegyezik a szomszédos régiókban lévő rekombináns frekvenciák szorzatával. A v-ct-cv rekombinációs adatokban a v–ct RF érték 0,132, az érték pedig 0,064, tehát kettős kombinációk várhatók a frekvencián0, 132 kb ct-CV0, 064 = 0,0084 (0,84 százalék), ha van függetlenség. Az 1448 legyből álló mintában 0,0084 6448 = 12 kettős rekombináns várható.De az adatok azt mutatják, hogy valójában csak 8-at figyeltek meg. Ha ez a kettős rekombinánsok hiányakövetkezetesen megfigyelték, akkor megmutatná nekünk, hogy a két régió nem független ésazt sugallják, hogy a crossoverek eloszlása az egyedülállóknak kedvez a páros rovására. Más szavakkal, van valamiféle interferencia: a crossover csökkenti a valószínűségeta crossover egy szomszédos régióban.
az interferenciát úgy számoljuk ki, hogy először kiszámítjuk a véletlen koefficiensnek (c.o.c.) nevezett kifejezést, amely a megfigyelt és a várható kettős rekombinánsok aránya 1-ből kivonva. Ezért
interferencia (I) = 1-c. o. c. =
példánkban
egyes régiókban soha nem figyeltek meg kettős rekombinánsokat. Ezekben az esetekben c.o. c. = 0, tehát I = 1 és az interferencia teljes. Legtöbbször a kromoszóma lókuszok feltérképezésekor észlelt interferencia értékek 0 és 1 között vannak; de bizonyos speciális helyzetekben a megfigyelt duplák meghaladják a vártakat, negatív interferenciaértékeket adva.
a rekombinációs analízis olyan erősen támaszkodik a hárompontos tesztkeresztezésekre és azok kibővített változataira, hogy érdemes lépésről lépésre összefoglalni az elemzést, interferenciaszámítással befejezve. A v,ct és cv lókuszok számértékeit használjuk.
Számítsa ki a rekombináns frekvenciákat minden génpárra:
kapcsolódási kapcsolatokat ábrázol egy kapcsolódási térképen:
határozza meg a kettős rekombináns osztályokat.
Számítsa ki a kettős rekombinánsok gyakoriságát és számát, ha nincs interferencia:
interferencia kiszámítása:
lehet, hogy elgondolkodott azon, hogy miért használunk mindig heterozigóta nőstényeket a tesztkeresztezéshez a Drosophila-I kapcsolat példáinkban. Amikor a PR vg / pr+ VG+hímeket keresztezik a PR vg/pr VG nőstényekkel, csak a PR vg/pr+ VG+és a pr VG/pr VG progenitás nyerhető vissza. Ez az eredmény azt mutatja, hogy a Drosophilamales-ben nincs átkelés. Ez a keresztezés hiánya azonban egy nemben bizonyos fajokra korlátozódik;nem minden faj hímje (vagy a heterogametikus nem) esetében. Más organizmusokban az XY hímeknél és a WZ nőstényeknél keresztezés történik. A Drosophila hímeknél a keresztezés hiányának oka az,hogy szokatlan I. fázisuk van, szinaptonemális komplexek nélkül.
egyébként rekombinációs különbség van az emberi nemek között is. A nők magasabb rekombináns frekvenciákat mutatnak ugyanazon lókuszoknál, mint a férfiak.