Küldés…
A. “kivágás és beillesztés”: i.egyetlen sorozat FASTA formátumban vagy csak egyszerű sorozat, vagy ii. több sorozat FASTA formátumban.
B. egy fájl FASTA formátumban. Írja be a fájl elérési útját közvetlenül vagy használjaa “Tallózás” gombot a fájl megtalálásához.
megjegyzés: a ChloroP csak aminosavszekvenciákat fogad el.
tartalmazza az N-végű
erősen ajánlott, hogy tartalmazza az N-végű a benyújtott sorozat.Minél távolabb van az N-terminális maradéktól a benyújtott szekvencia, annál inkábbnehéz és megbízhatatlan lesz a predikció.
Küldés előnyösen körülbelül 100 maradék
Küldés lehetőség szerint körülbelül 100 N-terminális maradék. A javasolt hosszúság annak a ténynek köszönhető, hogy a”cTP”/” no cTP ” prediktort 100 hosszúság bemeneti szekvenciáival képezték ki maradványok. A rövidebb szekvenciák azonban kielégítőek is lehetnekelőrejelzett (sokkal fontosabb, hogy az N-terminális rész sértetlen legyen). A tisztítás helyének előrejelzése a 100 legtöbb N-terminális szermaradékon belüli potenciális hasítási hely keresésére korlátozódik, és önmagában nem befolyásolja a szekvencia hossza.
Szekvencianevek
a szekvenciák neve bármilyen hosszúságú lehet, de csak az első 20 karakter marad meg a predikció során, és a chlorop predikció eredményoldalán jelenik meg.
részletes kimenet
jelölje be ezt a négyzetet, ha azt szeretné, hogy a neurális hálózat pontszáma is megjelenjen az egyes szekvenciákhoz (és nem csak az egyes szekvenciákhoz).Bemutatjuk a hálózati pontszám deriváltját is, amelyet annak a területnek a megkeresésére használnak, ahol a takarítási helyet keresik (a legmagasabb derivált pontszámmal rendelkező maradékot körülvevő 40 maradék), valamint az egyes maradékokra vonatkozó hasítási sitescore (CS-score) értéket.