a biológiai érdeklődésre számot tartó kémiai entitások (Chebi) a molekuláris entitások szabadon elérhető szótára, amely a kis kémiai vegyületekre összpontosít. A ‘molekuláris entitás’ kifejezés bármely alkotmányosan vagy izotóposan elkülönülő atomra, molekulára, ionra, ionpárra, gyökösre, gyökös ionra, komplexre, konformerre stb., külön megkülönböztethető entitásként azonosítható. A szóban forgó molekuláris entitások vagy a természet termékei, vagy szintetikus termékek, amelyeket az élő szervezetek folyamataiba való beavatkozásra használnak. A ChEBI magában foglal egy ontológiai osztályozást, amely meghatározza a molekuláris entitások vagy entitások osztályai és szüleik és/vagy gyermekeik közötti kapcsolatokat.
a ChEBI a következő nemzetközi tudományos testületek által jóváhagyott nómenklatúrát, szimbolikát és terminológiát használja:
a nemzetközi biokémiai és Molekuláris Biológiai Unió (IUPAC)nómenklatúra Bizottsága (NC-IUBMB)a genom által közvetlenül kódolt molekulák (pl. nukleinsavak, fehérjék és fehérjékből hasítással nyert peptidek) főszabály szerint nem tartoznak a ChEBI-be.