DNS-polimeráz bilincs-Rakodók

a kromoszómális DNS-replikációhoz a DNS-polimerázokat gyűrű alakú csúszó bilincsekhez kell kötni, amelyek körbeveszik a DNS-t, és lehetővé teszik a nagy sebességű, processzív replikációt. A csúszó bilincseket a bilincs rakodó komplex, az AAA+ atpázok családjának fehérjéinek pentamerikus összeállítása tölti be a DNS-be.

meg akarjuk érteni a bilincs rakodók működését és mechanizmusát atomi részletességgel. A T4 bakteriofág bilincs rakodó legújabb struktúrái komplex primer-sablon DNS-sel és a csúszó bilincs javasolt egy működő modellt a bilincs rakodó mechanizmusához az alábbiak szerint (lásd Kelch et al tudomány 2011):

modellünk azt jósolja, hogy az ATP hidrolízis az AAA+ spirál végén kezdődik, és szekvenciálisan halad felfelé a spirálon, ami a bilincs betöltő kilökődését eredményezi a DNS-ből és a zárt bilincsből. Hipotézisünket három egymást követő ATP hidrolízis esemény animációja szemlélteti:

ezeket a modelleket biokémiai, Biofizikai és szerkezeti módszerek széles skálájával teszteljük. A bilincs betöltő mechanizmusának atomi részletességgel történő megértése fontos következményekkel jár a DNS-replikáció, valamint a kapcsolódó AAA+ fehérjeegységek mechanizmusának megértésében. Végső soron arra számítunk, hogy mechanisztikus megértésünket felhasználva új nanoeszközöket és AAA+ funkciójú kis molekulájú effektorokat fejlesztünk ki.

Vélemény, hozzászólás?

Az e-mail-címet nem tesszük közzé.