gerjesztő szinaptikus transzmisszió közvetíthető az AMPA receptorok reakcióképességének megváltoztatásával. A válaszkészség megváltoztatásának egyik általános módszere az AMPA-receptorok számának megváltoztatása a posztszinaptikus membránban endocitózis útján. Különböző ingerek, beleértve a CNQX-et is, változatos hatással vannak az AMPA receptor internalizálására. Ismert, hogy az AMPA/kainát receptor kompetitív antagonistája, a CNQX-et olyan vizsgálatokban alkalmazzák, amelyek azt vizsgálják, hogy az AMPA receptor endocitózis ligandumfüggő-e vagy sem. A hippokampális neuronok kultúrájában a CNQX részben gátolta az AMPA által stimulált AMPA receptor internalizációt. Amikor azonban a hippokampusz neuronokat csak CNQX-szel kezelték, az AMPA receptor internalizálása továbbra is mind a soma, mind a dendritek esetében megtörtént. Az APV (NMDA receptor antagonista) vagy a nimodipin (feszültségfüggő kalciumcsatorna-blokkoló) szintén nem volt képes blokkolni ezt az internalizációt, ami arra utal, hogy a receptor aktiválása nem követelmény az AMPA receptor endocitózisához. A CNQX stimuláció eredményeként endocitált AMPA receptorok típusa a CNQX segítségével is azonosítható. A Glur alegységekkel jelölt HEK sejtekben a CNQX stimulálja a GluR1 és GluR2 receptorok internalizálását. A GluR1 és GluR2 C-terminális farokrészen konzervált intracelluláris régiót azonosították és törölték. Ennek a szegmensnek a deléciója a glur2 receptor konstitutív endocitózisának csökkenését eredményezte a hek sejtekben, meghatározva az ezt a hatást meghatározó szekvenciát.A
CNQX ismert, hogy szelektív kompetitív antagonista mind az AMPA receptorok számára, amelyek IC50 értéke 400 nM, mind a kainát receptorok számára, amelyek IC50 értéke 4 MHz. Nem versenyképes módon gátolja az NMDA receptorokat is. A CNQX-et tehát a GABAA receptor által közvetített spontán gátló posztszinaptikus áramok izolálására használják. A CNQX hatása a spontán gátló posztszinaptikus áramok gyakoriságára független az ionotróp glutamát receptorokon kifejtett hatásuktól. Bár a CNQX EC50 értéke a spontán gátló posztszinaptikus áramok gyakoriságán hasonló a kainát receptorok IC50 értékéhez, a kainát receptorok blokádja nem felelős a CNQX hatásaiért. Az NBQX egy kinoxalin-származék, amelyről ismert, hogy hatékonyabb, mint a CNQX a kainát receptorok blokkolásában, de a spontán gátló posztszinaptikus áramok gyakorisága nem nőtt jelentősen. Ezenkívül a CNQX hatásait nem replikálta a kinurenát (glutamát receptor antagonista) vagy az NS-102 (szelektív kainát receptor blokkoló), mivel a spontán gátló posztszinaptikus áramok gyakorisága nem növekedett. Ezenkívül a D-AP5 és a 7-CIK nem befolyásolta a spontán gátló posztszinaptikus áramok gyakoriságát, bizonyítva, hogy az NMDA receptorok hatása nem veszi figyelembe a CNQX hatásait.