Enviar…
A. por «cortar y pegar»: (i) una sola secuencia en formato FASTA o secuencia de un solo plano, o (ii) múltiples secuencias en formato FASTA.
B. un archivo en formato FASTA. Escriba la ruta de acceso al archivo directamente o use el botón «Examinar» para encontrar su archivo.
NOTA: El clorop solo acepta secuencias de aminoácidos.
Incluir el N-terminal
Se recomienda encarecidamente incluir el N-terminal de la secuencia enviada.Cuanto más lejos del residuo N-terminal comience la secuencia enviada, más difícil y poco fiable será la predicción.
Enviar preferiblemente alrededor de 100 residuos
Enviar si es posible alrededor de 100 residuos N-terminales. La longitud sugerida se debe al hecho de que el predictor «cTP»/»sin cTP» se entrenó con secuencias de entrada de residuos de longitud 100. Sin embargo, las secuencias más cortas también pueden ser satisfactorias (es más importante que la parte N-terminal esté intacta). La predicción del sitio de corte se limita a buscar un sitio de corte potencial dentro de los 100 residuos más N-terminales y no está influenciada por la longitud de la consecuencia.
Nombres de secuencia
El nombre de las secuencias puede ser de cualquier longitud, pero solo los primeros 20 caracteres se conservarán a lo largo de la predicción y se presentarán en la página de resultados de la predicción de Clorop.
Salida detallada
Marque esta casilla si desea que se presente la puntuación de la red neuronal también para cada residencia (y no solo para cada secuencia).También se presenta un derivado de la puntuación de red utilizada para encontrar el área en la que se busca el sitio de separación (los 40 residuos que rodean al residuo con la puntuación de derivada más alta), junto con el puntaje de sitio de escisión (score CS) para cada residuo.