El gen CIITA proporciona instrucciones para fabricar una proteína que ayuda principalmente a controlar la actividad (transcripción) de genes llamados genes de clase II del complejo de histocompatibilidad mayor (MHC). La transcripción es el primer paso en la producción de proteínas, y CIITA es fundamental para la producción de proteínas inmunitarias especializadas llamadas proteínas MHC de clase II a partir de estos genes. La proteína CIITA coordina varias proteínas para activar la transcripción de genes MHC clase II y permitir la producción de proteínas MHC clase II.
Las proteínas MHC de clase II se encuentran en la superficie de varios tipos de células inmunitarias, incluidos los glóbulos blancos (linfocitos) que participan en las reacciones inmunitarias. Estas proteínas desempeñan un papel importante en la respuesta inmunitaria del cuerpo a invasores extraños, como bacterias, virus y hongos. Para ayudar al cuerpo a reconocer y combatir las infecciones, las proteínas MHC de clase II se unen a fragmentos de proteínas (péptidos) de invasores extraños para que otras células especializadas del sistema inmunitario puedan interactuar con ellas. Cuando estas células del sistema inmunitario reconocen los péptidos como dañinos, activan los linfocitos y otras células inmunitarias para lanzar respuestas inmunitarias para deshacerse de los invasores extraños.
La proteína CIITA también parece desempeñar un papel en la mejora de la transcripción de los genes MHC de clase I, que proporcionan instrucciones para fabricar proteínas del sistema inmunitario llamadas proteínas MHC de clase I. Al igual que las proteínas MHC de clase II, las proteínas MHC de clase I se unen a péptidos de invasores extraños y los presentan a células específicas del sistema inmunitario. Estas células atacan a los invasores foráneos para liberarlos del cuerpo. Si bien la proteína CIITA puede ayudar a promover la actividad del gen MHC clase I, no es el regulador primario de estos genes. Otras proteínas desempeñan un papel más destacado en su transcripción.