Codoncode Aligner: Ensamblaje y alineación de secuencias de ADN en Windows y Mac OS X

CodonCode Aliger es un programa para ensamblaje de secuencias, edición de contig y detección de mutaciones, disponible para Windows y Mac OS X. Aliger es compatible con Phred-Phrap y es totalmente compatible con las puntuaciones de calidad de secuencias, al tiempo que ofrece una interfaz de usuario familiar y fácil de aprender, como se muestra en las siguientes capturas de pantalla:

Descripción general de Contig  Alineación con Árbol  Tabla de diferencias  Vistas de traza y Mapa de restricción

Descargar Codoncode Aligner

 CodonCode Aligner precios e información de pedido

Comprar

Con CodonCode Aligner, puede:

  • Importación de secuencias de archivos de texto
  • Importación de secuencias de ABI, SCF, y los archivos FASTQ
  • Final del clip
  • Vector de recorte
  • Montar contigs
  • Alinear a una secuencia de referencia
  • Alinear contigs el uno al otro, manteniendo los enlaces a las huellas
  • Montar o alinear en grupos, con base en la muestra nombres
  • Encontrar mutaciones heterocigotas
  • Analizar inserciones y eliminaciones heterocigotas
  • Definir regiones de interés («características»), por ejemplo regiones de consenso de baja calidad
  • Navegue rápidamente entre las funciones definidas por el usuario
  • Generar árboles filogenéticos y mapas de restricciones
  • Ejecutar Phred y Phrap directamente desde proyectos de alineadores
  • Exportar secuencias y características
  • Ver tablas de diferencias y traducciones de proteínas
  • Imprimaciones de diseño
  • Ensamblar genomas bacterianos y pequeños proyectos de secuenciación de NGS
  • Buscar enzimas para análisis de RFLP & crear gel virtual
  • Analizar secuencias metiladas & ver datos de trazas sin procesar

Codoncode Aligner le permite aprovechar al máximo algoritmos modernos para llamadas base y ensamblaje de secuencias, sin obligarle a aprender complicadas opciones de línea de comandos o programación Perl.

¿Te interesa? Siga adelante y descargue la versión demo de CodonCode Aligner. La versión demo es un visor y editor de trazas completamente funcional. Los usuarios primerizos obtienen una prueba automática de 30 días que le permite probar todas las funciones de CodonCode Aligner.

Después de la descarga, le sugerimos que vea el video de introducción para familiarizarse con las características más importantes de Aligner.En Facebook, de vez en cuando, ponemos a disposición de los fans registrados de CodonCode Aligner licencias con descuento; ¡consulte CodonCode Aligner en Facebook para obtener más detalles!

Alineador de codigos en Facebook

Deja una respuesta

Tu dirección de correo electrónico no será publicada.