La detección de las clases de recombinación doble muestra que deben ocurrir cruces dobles.Sabiendo esto, podemos preguntarnos si los cruces en regiones cromosómicas adyacentes son independientes o si un cruce en una región afecta la probabilidad de que haya un cruce en una región adyacente. Resulta que a menudo no son independientes: la interacción se llama interferencia.
El análisis se puede abordar de la siguiente manera. Si los cruces en las dos regiones son independientes, entonces, de acuerdo con la regla del producto (véase la página 37), la frecuencia de combinaciones dobles sería igual al producto de las frecuencias recombinantes en las regiones adyacentes. En los datos de recombinación v-ct-cv, el valor de RF de v–ct es 0.132 y el valor es 0.064, por lo que se pueden esperar combinantes dobles a la frecuencia0, 132 × ct–cv0, 064 = 0.0084 (0.84 por ciento) si hay independencia. En la muestra de 1448 moscas, se espera 0,0084 × 1448 = 12 recombinantes dobles.Pero los datos muestran que solo se observaron 8. Si esta deficiencia de recombinantes dobles se observara consistentemente, nos mostraría que las dos regiones no son independientes y sugiere que la distribución de cruces favorece a los solteros a expensas de los dobles. En otras palabras, hay algún tipo de interferencia: un cruce reduce la probabilidad de un cruce en una región adyacente.
La interferencia se cuantifica calculando primero un término llamado coeficiente de coincidencia (c. o.c.), que es la relación de recombinantes dobles observados a esperados extraídos de 1. Por lo tanto
Interferencia (I) = 1 − c. o.c. =
En nuestro ejemplo
En algunas regiones, nunca se observan recombinantes dobles. En estos casos, c. o. c. = 0, por lo que I = 1 y la interferencia es completa. La mayoría de las veces, los valores de interferencia que se encuentran en el mapeo de loci cromosómicos están entre 0 y 1; pero, en ciertas situaciones especiales,los dobles observados exceden lo esperado, dando valores de interferencia negativos.
El análisis de recombinación se basa tan fuertemente en cruces de prueba de tres puntos y versiones extendidas de los mismos que vale la pena hacer un resumen paso a paso del análisis, terminando con un cálculo de interferencia. Utilizaremos valores numéricos de los datos de los loci v,ct y cv.
Calcular frecuencias recombinantes para cada par de genes:
Representa relaciones de enlace en un mapa de enlace:
Determina las clases recombinantes dobles.
Calcular la frecuencia y el número de recombinantes dobles esperados si no hay interferencia:
Calcular la interferencia:
Es posible que se haya preguntado por qué siempre usamos hembras heterocigotas para los cruces de prueba en nuestros ejemplos de enlace en Drosophila. Cuando los machos pr vg/pr+ vg + se cruzan con hembras pr vg/pr vg, solo se recuperan los progenitores pr vg/pr+ vg+y pr vg/pr vg. Este resultado muestra que no hay cruce en Drosophilamales. Sin embargo, esta ausencia de cruce en un sexo se limita a ciertas especies; no es el caso de los machos de todas las especies (o para el sexo heterogamético). En otros organismos, hay cruce en machos XY y en hembras WZ. La razón de la ausencia de cruce en los machos de Drosophila es que tienen una profase I inusual,sin complejos sinaptonémicos.
Incidentalmente, también hay una diferencia de recombinación entre sexos humanos. Las mujeres muestran frecuencias recombinantes más altas para los mismos loci que los hombres.