ABSTRACT
myeloïde cellen zijn belangrijke plaatsen van lytische en latente infectie met humaan cytomegalovirus (CMV). We hebben eerder aangetoond dat slechts een kleine subset van myeloïde cellen onderscheiden van CD34+ hematopoëtische stamcellen toelaatbaar is voor CMV replicatie, wat de heterogene aard van deze populaties onderstreept. De nauwkeurige identiteit van vatbare en bestand celtypes, en de cellulaire eigenschappen die permissive cellen karakteriseren, nochtans, konden niet worden ontleed gebruikend het gemiddelde transcriptional analyse hulpmiddelen zoals microarrays en, vandaar, bleef raadselachtig. Hier profileren we de transcriptomen van ∼ 7000 individuele cellen op dag één post-infectie met behulp van het 10x genomics platform. Wij tonen aan dat de virale afschriften in de meerderheid van de cellen detecteerbaar zijn, die voorstellen dat de ingang van virion onwaarschijnlijk is om het belangrijkste doel van cellulaire beperkingsmechanismen te zijn. We tonen verder aan dat virale replicatie plaatsvindt in een kleine maar specifieke subgroep van cellen transcriptioneel gerelateerd aan, en waarschijnlijk afgeleid van, een cluster van cellen die markers van kolonievormende eenheid uitdrukken-granulocyt, erytrocyt, monocyt, megakaryocyt (CFU – GEMM) oligopotente voorlopercellen. Vergeleken met de rest van de populatie worden CFU-GEMM-cellen verrijkt in transcripten met functies in mitochondriale energieproductie, celproliferatie, RNA-verwerking en eiwitsynthese, en drukken vergelijkbare of hogere niveaus van interferon-gerelateerde genen uit. Terwijl de uitdrukkingsniveaus van de eerstgenoemde in besmette cellen worden gehandhaafd, zijn de laatstgenoemde sterk down-geregeld. We stellen dus voor dat de voorkeursbesmetting van CFU-GEMM-cellen te wijten kan zijn aan de aanwezigheid van een vooraf vastgestelde Pro-virale omgeving, die minimale optimalisatie-inspanningen van virale effectoren vereist, in plaats van aan de afwezigheid van specifieke restrictiefactoren. Samen identificeren deze bevindingen een potentieel nieuwe populatie myeloïde cellen die gevoelig zijn voor CMV-replicatie, en bieden zij een mogelijke reden voor hun voorkeursbesmetting.
samenvatting van de auteur myeloïde cellen zoals monocyten en dendritische cellen zijn kritische doelwitten van CMV-infectie. Om de cellulaire factoren te identificeren die gevoeligheid of resistentie voor infectie verlenen, profileerden we de transcriptomen van ∼ 7.000 enkele cellen uit een populatie van semi-permissieve myeloïde cellen die geïnfecteerd zijn met CMV. Wij vinden dat een virale Rna detecteerbaar zijn in de meerderheid van de cellen, maar dat die uitdrukking van CMV dodelijke genen treedt slechts een kleine subset van cellen transcriptionally in verband met een cluster van KVE-GEMM voorouders die vergelijkbaar zijn met die van afschriften codering interferon-gerelateerde anti-virale factoren, zoals de rest van de bevolking, maar de hogere niveaus van afschriften codering van eiwitten die nodig zijn voor energie -, RNA en eiwit productie. We concluderen dus dat de voorkeursbesmetting van CFU-GEMM-cellen te wijten zou kunnen zijn aan de reeds bestaande aanwezigheid van een intracellulaire omgeving die bevorderlijk is voor het begin van de infectie, in plaats van aan de afwezigheid van antivirale factoren die de virale entry of initiële genexpressie beperken. Samen brengen deze bevindingen een nieuw type myeloïde cellen aan het licht die mogelijk toelaatbaar zijn voor CMV – infectie, breiden ons inzicht in de cellulaire vereisten voor succesvolle initiatie van CMV-infectie uit en bieden nieuwe Pro-en antivirale genkandidaten voor toekomstige analyses en therapeutische interventies.