Carlos Justiniano Ribeiro Chagas wurde am 9. Juli 1879 in der Stadt Oliveira, Brasilien, von Bauern geboren, deren Nachkommen im siebzehnten Jahrhundert nach Brasilien kamen. Vor dem Tod seines Vaters, als Carlos vier Jahre alt war, besaßen seine Eltern aus der Oberschicht eine kleine Kaffeeplantage. Carlos widersetzte sich der Überredung seiner Mutter, Bergbauingenieur zu werden, und entschied sich stattdessen für die medizinische Fakultät, die von einem Onkel des Arztes beeinflusst wurde, der ihn davon überzeugte, dass sich für Brasilien industriell war es notwendig, das Land von endemischen Krankheiten zu befreien. Viele europäische Schiffe weigerten sich, in brasilianischen Häfen anzulegen, da das Risiko bestand, an Gelbfieber, Pocken, Beulenpest und Syphilis zu erkranken.
Carlos studierte 1902 am Oswaldo Cruz Institut, wo er seine Doktorarbeit über die „hämatologischen Aspekte der Malaria“ unter dem führenden brasilianischen Parasitologen Oswaldo Cruz schrieb. Dr. Cruz ‚Arbeit war entscheidend im Kampf gegen Gelbfieber in Rio de Janeiro. Er lieferte Impfungen gegen Pest und Pocken, als die Ausrottung von Vektoren und Massenimpfungen als revolutionäre Maßnahmen galten. Carlos Chagas lehnte die Einladung von Dr. Cruz ab, an der Malariaforschung zu arbeiten, und wollte stattdessen Familienmedizin praktizieren. Später führte Chagas eine Antipest-Serotherapie ein, während er in einem Jurujuba-Krankenhaus arbeitete. Dr. Cruz modifizierte die von Pasteur 1890 eingeführte Serotherapie, und Chagas folgte Pasteurs und Cruz ‚Annahmen, dass negative organische Elemente positive organische Elemente fermentierten. Dr. Chagas war ein sehr innovativer und experimenteller Arzt, der eher in der Praxis als im Labor nach Antworten suchte.
Chagas gelang es priamos, Malaria zu bekämpfen, weil er Feldforschung betrieben, die Krankheit in ihrer Umgebung beobachtet und das Problem auf wissenschaftliche und therapeutische Weise angegangen hat. Er arbeitete auch mit Patienten, Parasiten und Insekten in epidemischen Umgebungen, um eine vergrößerte Perspektive der Krankheit zu erhalten. Chagas trug zur Malariologie bei und wurde 1906 Mitarbeiter des Oswaldo Cruz Institute in Rio de Janeiro. 1908 lud die Central Railroad of Brasil Chagas ein, nach Lassance zu fahren, einer ausgelassenen Eisenbahnarbeiterstadt am Ende der neuen Eisenbahnlinie durch Brasilien, wo eingewanderte Eisenbahnarbeiter an Malaria starben. Chagas richtete ein einfaches Labor ein. Chagas stellte fest, dass einige Symptome nicht von Malaria herrührten, und erhielt später ein Insekt, ein Vinchuca, das nachts Blut von den Arbeitern saugte. Er entdeckte Flagellaten im Hinterdarm des Käfers. Er fand heraus, dass dies Protozoen waren, die denen ähnelten, von denen bekannt war, dass sie afrikanische Schlafkrankheit verursachen. Nachfolgende Untersuchungen ergaben, dass der Infektionszyklus des Trypanosoms, das später T. Cruz (nach Chagas ‚Mentor) genannt wurde, in direktem Zusammenhang mit Armut stand, wie sie in Lassance bestand. Eine erstaunliche Entdeckungsrate führte 1909 zur Isolierung der Ursache der Krankheit. Die Forschung zur Chagas-Krankheit hat sich seit Chagas ‚Tod im Jahr 1933 verlangsamt.