Der Nachweis der doppelten rekombinanten Klassen zeigt, dass doppelte Kreuzungen auftreten müssen.Wenn wir dies wissen, können wir fragen, ob die Überkreuzungen in benachbarten Chromosomenregionen unabhängig sind oder ob eine Überkreuzung in einer Region die Wahrscheinlichkeit einer Überkreuzung in einer benachbarten Region beeinflusst. Es stellt sich heraus, dass sie oft nicht unabhängig sind: Die Interaktion wird Interferenz genannt.
Die Analyse kann auf folgende Weise angegangen werden. Wenn die Kreuzungen in den beiden Regionen sindunabhängig, dann wäre nach der Produktregel (siehe Seite 37) die Häufigkeit der Doppelkombinanten gleich dem Produkt der rekombinanten Frequenzen in den benachbarten Regionen. In den v-ct-cv-Rekombinationsdaten beträgt der v-ct-RF-Wert 0,132 und der Wert 0,064, so dass doppelte Kombinationen bei der Frequenz 0,132 × ct–cv 0,064 = 0,0084 (0,84 Prozent) zu erwarten sind, wenn eine Abhängigkeit vorliegt. In der Stichprobe von 1448 Fliegen werden 0,0084 × 1448 = 12 Doppelrekombinanten erwartet.Aber die Daten zeigen, dass nur 8 tatsächlich beobachtet wurden. Wenn dieser Mangel an Doppelrekombinanten konsequent beobachtet würde, würde dies uns zeigen, dass die beiden Regionen nicht unabhängig sind und darauf hindeuten, dass die Verteilung der Frequenzweichen Singles auf Kosten von Doubles begünstigt. Mit anderen Worten, es gibt eine Art von Interferenz: Eine Frequenzweiche verringert die Wahrscheinlichkeit einer Frequenzweiche in einer benachbarten Region.
Die Interferenz wird quantifiziert, indem zuerst ein Term berechnet wird, der als Koinzidenzkoeffizient (c.o.c.) bezeichnet wird, der das Verhältnis von beobachteten zu erwarteten Doppelrekombinanten ist, die von 1 abgezogen werden. Daher
Interferenz (I) = 1 – c.o.c. =
In unserem Beispiel
In einigen Regionen gibt es nie beobachtete Doppelrekombinanten. In diesen Fällen ist c.o.c. = 0, also I = 1 und die Interferenz ist vollständig. Meistens liegen die Interferenzwerte, die bei der Kartierung von Chromosomenloci auftreten, zwischen 0 und 1; In bestimmten Sondersituationen übersteigen die beobachteten Doppel jedoch die erwarteten und ergeben negative Interferenzwerte.
Die Rekombinationsanalyse beruht so stark auf Dreipunkt-Testkreuzungen und erweiterten Versionen von ihnen, dass es sich lohnt, eine schrittweise Zusammenfassung der Analyse zu erstellen, die mit einer Interferenzberechnung endet. Wir werden numerische Werte aus den Daten der v-, ct- und cv-Loci verwenden.
Rekombinante Häufigkeiten für jedes Genpaar berechnen:
Verknüpfungsbeziehungen in einer Verknüpfungskarte darstellen:
Bestimmen Sie die doppelten rekombinanten Klassen.
Berechnen Sie die Häufigkeit und Anzahl der zu erwartenden Doppelrekombinanten, wenn keine Interferenz vorliegt:
Interferenz berechnen:
Sie haben sich vielleicht gewundert, warum wir in unseren Beispielen für die Verknüpfung von Drosophila immer heterozygote Weibchen für Testkreuzungen verwenden. Wenn Pr vg/pr+ vg+Männchen mit pr vg/pr vg Weibchen gekreuzt werden, werden nur pr vg/pr+ vg+ und pr vg/pr vg Nachkommen gewonnen. Dieses Ergebnis zeigt, dass es keine Kreuzung in Drosophilamales gibt. Dieses Fehlen einer Kreuzung bei einem Geschlecht ist jedoch auf bestimmte Arten beschränkt; Dies gilt nicht für Männer aller Arten (oder für das heterogametische Geschlecht). In anderen Organismen kommt es bei XY-Männchen und bei WZ-Weibchen zu Kreuzungen. Der Grund für das Fehlen vonKreuzung bei Drosophila-Männchen ist, dass sie eine ungewöhnliche Prophase I haben,ohne synaptonemale Komplexe.
Übrigens gibt es auch einen Rekombinationsunterschied zwischen menschlichen Geschlechtern. Frauen zeigen höhere rekombinante Frequenzen für die gleichen Loci als Männer.