CodonCode Aligner-DNA Sequence Assembly and Aligner on Windows and Mac OS X

Posted on by admin

CodonCode Aligner is een programma voor sequence assembly, contig editing en mutatiedetectie, beschikbaar voor Windows en Mac OS X. Aligner is compatibel met Phred-Phrap en ondersteunt volledig sequence quality scores, terwijl het een vertrouwde, eenvoudig te leren gebruikersinterface biedt, zoals getoond in de volgende schermafbeeldingen:

Contig Overzicht Uitlijning met Boom Verschil Tabel Trace Uitzicht en Beperking Kaart

Download CodonCode Aligner

CodonCode Aligner prijzen en informatie over het bestellen

Kopen

Met CodonCode Aligner, kunt u:

  • Importeren sequenties van tekst bestanden
  • Importeren sequenties van ABI, SCF, en FASTQ bestanden
  • Einde fragment
  • Vector trim
  • Monteren contigs
  • het Uitlijnen van een referentie-reeks
  • Lijn contigs elkaar terwijl de koppelingen naar de sporen
  • Monteren en uitlijnen in groepen, gebaseerd op de steekproef namen
  • Vind heterozygote mutaties
  • Analyseren heterozygoot invoegingen en verwijderingen
  • het Definiëren van de regio ‘ s van belang (“features”), bijvoorbeeld lage kwaliteit consensus regio ‘ s
  • Snel navigeren tussen gebruiker gedefinieerde functies
  • het Genereren van fylogenetische bomen en beperking kaarten
  • Voer Phred en Phrap direct van Aligner projecten
  • Export reeksen en functies
  • Zie verschil tabellen en eiwit vertalingen
  • Ontwerp primers
  • Monteren van bacteriële genomen en kleine NGS sequencing projecten
  • het Vinden van enzymen voor RFLP analyse & maak virtuele gel
  • Analyseren gemethyleerd sequenties & bekijk de raw-trace gegevens

CodonCode Aligner kunt u optimaal profiteren van moderne algoritmen voor basis bellen en sequence assemblage, zonder u te dwingen om ingewikkelde command line opties of Perl programmering te leren.

geïnteresseerd? Ga je gang en download de demoversie van CodonCode Aligner. De demo-versie is een volledig functionele trace viewer en editor. First-time gebruikers krijgen een automatische 30-dagen trial die u toelaat om de uit te proberen alle functies in CodonCode Aligner.

na het downloaden raden we u aan de introductievideo te bekijken om vertrouwd te raken met de belangrijkste functies van Aligner.

we maken af en toe kortingsvrije licenties beschikbaar voor geregistreerde fans van CodonCode Aligner op Facebook – kijk op CodonCode Aligner op Facebook voor meer informatie!

Codoncode-Uitlijner op Facebook

Geef een antwoord

Het e-mailadres wordt niet gepubliceerd.