Chromosoomgebieden en de wereldwijde regulatie van het genoom

ruimtelijke positionering is een fundamenteel principe voor nucleaire processen. Chromatin wordt georganiseerd als hiërarchie van nucleosomes aan MBP chromatin domeinen (CD) of topologisch associating domeinen (TADs) aan hogere niveaucompartimenten culminerend in chromosoomgebieden (CT). De microscopische en het rangschikken technieken hebben chromatin organisatie onderbouwd als kritieke factor die genuitdrukking regelt. Bijvoorbeeld, de lijn van de versterkers Terug om met hun doelgenen bijna uitsluitend binnen TADs in wisselwerking te staan, distaal gelegen coregulated genen herpositioneren in gemeenschappelijke transcriptiefabrieken op activering, en MBP-CDs stellen dynamische beweging en configuratieveranderingen in vivo tentoon. Een al lang bestaande vraag in het kernveld is of een interactieve kernmatrix een directe link biedt tussen structuur en functie. De bevindingen van nonrandom radiale positionering van CT binnen de kern suggereren de mogelijkheid van preferentiële interactiepatronen onder populaties van CT. Sequentiële etikettering tot 10 CT gevolgd door toepassing van computerweergave en geometrische grafiekmijnalgoritmen onthulde cel‐type specifieke interchromosomal netwerken (ICN) van CT die tijdens de celcyclus, differentiatie, en kankervooruitgang worden veranderd. Voorgesteld wordt dat het ICN correleert met het wereldwijde niveau van genoomregulering. Deze benaderingen toonden ook aan dat de grote schaal 3‐D topologie van CT specifiek is voor elke CT. De cel-type specifieke nabijheid van bepaalde chromosomale gebieden in normale cellen kan de neiging van verschillende translocaties in kanker subtypes verklaren. Inzicht in hoe genen ontregeld zijn bij verstoring van de normale “bedrading” van de kern door translocaties, deleties en versterkingen die kenmerken van kanker zijn, moet meer gerichte therapeutische strategieën mogelijk maken.

Geef een antwoord

Het e-mailadres wordt niet gepubliceerd.