de detectie van de dubbele recombinantklassen toont aan dat dubbele crossovers moeten voorkomen.Dit wetende, kunnen we vragen, zijn de crossovers in aangrenzende chromosoom regio ‘ s onafhankelijk of doet een crossover in een regio van invloed op de kans dat er een crossover in een aangrenzende regio. Het blijkt dat ze vaak niet onafhankelijk zijn: de interactie wordt interferentie genoemd.
de analyse kan als volgt worden benaderd. Als de overgangen in de twee regio ’s onafhankelijk zijn, dan zou, volgens de productregel (zie blz.37), de frequentie van dubbele combinaties gelijk zijn aan het product van de recombinantfrequenties in de aangrenzende regio’ s. In de V–ct-cv recombinatiegegevens is de V-ct RF-waarde 0,132 en de waarde 0,064, dus dubbele combinaties kunnen worden verwacht bij de frequentie0, 132 × ct–cv0, 064 = 0,0084 (0,84 procent) als er onafhankelijkheid is. In de steekproef van 1448 vliegen worden 0,0084 × 1448 = 12 dubbele recombinanten verwacht.Maar de gegevens tonen aan dat er slechts 8 werden waargenomen. Als deze tekortkoming van dubbele recombinanten consequent werd waargenomen, zou het ons laten zien dat de twee regio ‘ s niet onafhankelijk zijn en dat de verdeling van crossovers singles begunstigt ten koste van doubles. Met andere woorden, er is een soort van interferentie: een crossover vermindert de waarschijnlijkheid van een crossover in een aangrenzende regio.
interferentie wordt gekwantificeerd door eerst een term te berekenen die de coïncidentiecoëfficiënt (c.o.c.) wordt genoemd, de verhouding tussen waargenomen en verwachte dubbele recombinanten die wordt verkregen uit 1. Derhalve
interferentie (I) = 1 − c.o.c. =
in ons voorbeeld
in sommige regio ‘ s worden nooit dubbele recombinanten waargenomen. In deze gevallen, c. o. c. = 0, dus I = 1 en interferentie is voltooid. De meeste van de tijd, de interferentie waarden die zijnencountered in het in kaart brengen van chromosoom loci zijn tussen 0 en 1; maar in bepaalde speciale situaties,waargenomen doubles overtreffen de verwachte, waardoor negatieve interferentie waarden.
Recombinatieanalyse berust zo sterk op driepuntenproefcrossen en uitgebreide versies daarvan dat het de moeite waard is een stapsgewijze samenvatting van de analyse te maken, eindigend met een interferentieberekening. We zullen numerieke waarden uit de gegevens op de V,ct, en cv loci gebruiken.
bereken recombinant frequenties voor elk paar genen:
representeren koppelingsrelaties in een koppelingskaart:
Bepaal de dubbele recombinant-klasse.
Bereken de frequentie en het aantal verwachte dubbele recombinanten als er geeninterferentie is:
interferentie berekenen:
je hebt je misschien afgevraagd waarom we altijd heterozygote vrouwtjes gebruiken voor testcrossen in onze voorbeelden van linkage bij Drosophila. Wanneer PR vg/pr+ VG+mannetjes worden gekruist met pr vg/pr vg vrouwtjes, worden alleen PR vg/pr+ VG+en pr vg / pr vg voorouders teruggevonden. Dit resultaat laat zien dat er geen kruising is in Drosophilamales. Deze afwezigheid van kruising in één geslacht is echter beperkt tot bepaalde soorten; Dit is niet het geval voor mannetjes van alle soorten (of voor het heterogametische geslacht). In andere organismen is er kruising bij XY mannetjes en bij WZ vrouwtjes. De reden voor de afwezigheid van crossingover bij Drosophila mannetjes is dat ze een ongewone profase I hebben,zonder synaptonemale complexen.
Overigens is er ook een recombinatieverschil tussen de menselijke geslachten. Vrouwen tonen hogere recombinant frequenties voor dezelfde loci dan mannen.