“In een vorige studie hadden we voorgesteld dat zowel duplicaties als deleties van een klein stukje chromosoom 17 en ook afzonderlijke mutaties allemaal plaatsvonden in dezelfde gebeurtenis,” zei co-eerste auteur Dr.Claudia M. B. Carvalho assistant professor of molecular and human genetics aan Baylor College Of Medicine. “Hier gebruikten we een scala aan technologieën met hoge resolutie en krachtige statistische analyses om onze eerdere waarnemingen te bevestigen en uit te breiden. Om dit te bereiken namen we een nadere blik op de genetische veranderingen in dit kleine stukje chromosoom 17 in een grote cohort van niet-verwante patiënten met ofwel Potocki-Lupski of Smith-Magenis syndroom.”
” we vonden dat het cohort in twee groepen kan worden verdeeld. Eén groep omvat individuen die dezelfde veranderingen op hetzelfde gebied van DNA gemeen hebben. We noemen ze terugkerende wijzigingen omdat we terugkerende deleties of duplicaties van dezelfde DNA-segmenten observeren, ” zei co-first auteur Dr. Christine R. Beck, een voormalige postdoctorale fellow aan Baylor die momenteel is een assistent-professor in de afdeling genetica en Genoomwetenschappen aan de Universiteit van Connecticut Health Center en het Jackson Laboratory for Genomic Medicine.
in de tweede groep, de onderzoekers noemen het niet-recidiverend, elk van de patiënten had een ander patroon van DNA-veranderingen.”The pattern of variation within the non-recurrent group is more complex than that of the recurrent group,” zei Beck. “We stellen voor dat de niet-terugkerende en de terugkerende herschikkingen plaatsvinden door verschillende mechanismen.”
de onderzoekers vergeleken vervolgens de recidiverende en niet-recidiverende monsters met betrekking tot het aantal DNA single base pair mutaties. Als referentie, vergeleken zij ook de geduldige steekproeven met die van hun respectieve ouders en met steekproeven van individuen zonder de Voorwaarden.
” in de recidiverende groep zagen we slechts vier van de 19 patiënten met mutaties binnen deze regio ‘s, terwijl 13 van de 26 patiënten in de niet-recidiverende groep mutaties hadden en deze voorkwamen in een frequentie die 5 tot 50 keer hoger was,” zei Carvalho. “De meeste van deze mutaties kwamen voor in genen. Dit is belangrijk omdat dit soort mutaties kunnen bijdragen aan de ziekte.”
” onze statistische analyses toonden aan dat de mutaties gloednieuw waren bij de patiënten — de ouders dragen ze niet. De mutaties komen ook samen met de duplicaties of deleties op hetzelfde chromosoom 17, en kan optreden over een lange strook van deze regio, ” zei coauteur Dr. Zeynep Coban-Akdemir, een computerwetenschapper en genetica en genomics postdoctorale medewerker van moleculaire en menselijke genetica bij Baylor.”Verder, “zei coauteur Xiaofei Song, een afgestudeerde student in moleculaire en menselijke genetica aan Baylor,” onze analyses vonden dat een groot aantal mutaties optreden rond breekpunten, de plaatsen op het DNA waar deleties of duplicaties plaatsvinden, en dat de mutaties de neiging hebben om dicht bij elkaar te zijn.”
deze studie heeft een venster geopend naar de complexiteit van de genetische veranderingen in dit kleine gebied van chromosoom 17 die leiden tot deze twee zeldzame aandoeningen en suggereert dat andere aandoeningen waarbij duplicaties of deleties van chromosoomsegmenten optreden door soortgelijke mechanismen.”Vier vrouwelijke wetenschappers, Claudia, Zeynep, Xiaofei en Christine, uit alle hoeken van de wereld (Brazilië, turkije, China en de VS) hebben een verbazingwekkend stukje wetenschap uitgehaald en ons onderweg veel geleerd”, aldus Co-correspondent Dr. James R. Lupski, Cullen hoogleraar moleculaire en menselijke genetica aan Baylor, hoofdonderzoeker aan het Baylor Hopkins Center for Mendelian Genomics en faculteit met het Baylor genetics and genomics graduate training program.