Möt mikrobiologen kampen för att studera hepatit C-virus med Charlie Rice

Charlie Rice ger historien att lära sig att växa hepatit C-virus i kultur, från fallgropar till hinder och framgångar längs den 20-åriga resan. Han talar också om gula febervirus, dess vaccin och vikten av nyfikenhetsdriven forskning.
prenumerera (gratis) på Apple Podcasts, Google Podcasts, Android, RSS eller via e-post.

Julies största Takeaways

att lära sig virusgenomsekvenserna ledde till omkategorisering av Togaviridae, som tidigare grupperades baserat på liknande viral struktur. Nya virus kan identifieras baserat på deras homologer till befintliga virala sekvenser, men många nya virus kodar gener utan kända homologer – den mörka materien av virala sekvenser!
vi förstår fortfarande inte den exakta mekanismen genom vilken cirros kan utvecklas till levercancer. Människor diskuterar fortfarande om det är en direkt viral effekt eller om det är det kroniska långsamt progressiva immunsvaret som skadar levern, vilket leder till nya leverceller och potentiellt leder till Mutagena tillstånd.
det har varit en lång väg att utveckla in vitro-system för att studera hepatit C-virus:

• identifierades först 1989
• en cDNA-klon av HCV gjordes 1997, vid vilken tidpunkt den kunde förökas i en schimpansmodell av infektion. Men att hitta en tillåten cellinje för att växa HCV visade sig vara svårt.
• integron-systemet kom nästa: att ersätta de strukturella generna med en valbar markör innebar att virusreplikationssystemet kunde testas i cellinjer, även om viral avkomma inte producerades.
• Lentivirus dekorerat med HCV-glykoproteiner tillät studier av viral bindning och inträde.
• 2005 kunde ett sällsynt HCV-isolat (JF09) från en patient i Japan med akut fulminant sjukdom replikera utan adaptiva mutationer och produktion av infektiös viral avkomma!

Hur gör du djurmodell för infektion?

• ändra genetiken hos djuret för att efterlikna det mänskliga tillståndet
• växa verkliga mänskliga celler inuti en mus
• hitta ett hepatit C-liknande virus som naturligt infekterar möss för att studera naturliga virus-värd interaktioner

Interferonbaserad behandling var lång och hade dåliga biverkningar. Studier från modellsystem underlättade utvecklingen av nya läkemedel, såsom en nukleotidprodrug som riktar sig mot det RNA-beroende RNA-polymeraset, som har färre biverkningar och en kortare behandlingskurs.
17D gul febervaccin är en försvagad stam som ger livslång immunitet mot alla stammar av gul feber. Varför är detta vaccin ett så bra vaccin? Att förstå vaccineffektivitet kan hjälpa till att utforma bättre vacciner för andra sjukdomar.

Dagens citat

” en av de intressanta egenskaperna hos hepatit C jämfört med några av de andra flavivirus som gula febern virus till exempel är att det är mycket bra på att etablera och upprätthålla en kronisk infektion i de flesta människor som är smittade. Så om du går vidare till detta kroniska stadium, som förekommer hos cirka 60-70% av de som smittas, sitter du fast med viruset för livet om du inte behandlas framgångsrikt.”
” Hepatacyter är ökända för att ändra sin transkriptionsprofil och förlora sin differentiering när du plåtar dem i cellodling.”
” problemet med att arbeta med xenografter i en musmodell är att du arbetar med ett djur som i grunden är bristfälligt i T-celler och B-celler, och ofta även NK-celler. Det betyder att det är ungefär som ett furigt provrör – du kan infektera djuren, men de har inte det immunsvar som vi tycker är viktigt för patologin i samband med kroniska hepatit C-infektioner.”
nuvarande utbrott av gul feber ” ger dig en uppskattning för den cykliska karaktären hos våra folkhälsoåtgärder och metoder så att även när du har ett effektivt vaccin, blir det inte nödvändigtvis enhetligt tillämpat och vi hamnar ofta i en mer reaktiv situation när dessa epidemier börjar dyka upp igen.”
” du skulle tro att ha dessa fantastiska nya droger skulle vara som att vända en switch-vi kan nu identifiera de personer som är smittade och behandla dem. Men det är faktiskt väldigt spottigt, beroende på land, kostnad och hälsovårdssystem – och hur de varierar mellan länder och även inom ett land.”
” jag ber om nyfikenhetsdriven forskning eftersom vi aldrig riktigt vet när insikter får nytta av det kommer att vara till nytta!”

Länkar för det här avsnittet