Berthold Hatschek (3 April 1854 – 18 januari 1941) var en österrikisk zoolog ihågkommen för embryologiska och morfologiska studier av ryggradslösa djur.
han studerade zoologi i Wien under Carl Claus (1835-1899) och i Leipzig med Rudolf Leuckart (1822-1898). Han fick sin doktorsexamen vid universitetet i Leipzig med en avhandling med titeln Beitr occur Entwicklungsgeschichte der Lepidopteren. Hatschek påverkades djupt av Ernst Haeckels verk (1834-1919).
år 1885 utsågs han till professor i zoologi vid Karlsuniversitetet i Prag, och från 1896 var han professor och chef för andra zoologiska institutet vid universitetet i Wien. Hatschek led av svår depression, vilket i hög grad påverkade hans arbete i de senare stadierna av hans liv.
Hatschek är ihågkommen för den så kallade ”trokoforteorin”, där han förklarar att trokoforen är larvformen för en hypotetisk organism-”trochozoon” (som i vuxen form motsvarade en trokoforliknande roterare och var den föreslagna gemensamma förfadern till nästan alla bilaterala, metazoiska livsformer).
1888 delade han Frey och Leuckarts Coelenterata i tre phyla: Spongiaria, Cnidaria och Ctenophora. Från sin forskning om amphioxus härleds de anatomiska termerna- ”Hatscheks grop” och ”Hatscheks nefridium”.