Submeter…
A. por “cortar e colar”: (i) uma sequência única em formato FASTA ou sequência onlyplain, ou (ii) sequências múltiplas em formato FASTA.
B. A file in FASTA format. Introduza a localização do ficheiro directamente ou use o botão “Navegar” para encontrar o seu ficheiro.Nota: O Clorop só aceita sequências de aminoácidos.
incluir o n-terminus
é fortemente recomendado incluir o n-terminus da sequência submetida.Quanto mais longe do resíduo N-terminal a sequência apresentada começar, mais difícil e pouco fiável será a previsão.
apresentar, de preferência, cerca de 100 resíduos
apresentar, se possível, cerca de 100 resíduos n-terminais. O comprimento sugerido é devido ao fato de que o predictor “cTP”/”no cTP” foi treinado com seqüências de entrada de comprimento 100 resíduos. No entanto, sequências mais curtas podem também ser indicadassatisfatórias (é mais importante que a parte N-terminal esteja intacta). A previsão do sítio de dissociação é limitada à procura de um local de dissociação potencial com a maior parte dos 100 resíduos n-terminais e não é, por si só, influenciada pelo comprimento da sequênciadeuminquérito.
nomes de sequência
o nome das sequências pode ser de qualquer comprimento, mas apenas os primeiros 20 caracteres serão preservados ao longo da Previsão e apresentados na página de resultados da previsão de theChloroP.
saída detalhada
Assinale esta opção se quiser que a Pontuação da rede neural também seja apresentada para cada resíduo (e não apenas para cada sequência).Um derivado da Pontuação da rede utilizada para encontrar a área em que o sítio de dissociação é procurado (os 40 resíduos que rodeiam o resíduo com a pontuação mais elevada dos derivados) é também apresentado, juntamente com o sitescore de dissociação (pontuação CS) para cada resíduo.