IMAGE: Artist’s impression of chromothripsis. ver mais
crédito: Spencer Phillips/EMBL-EBI
pesquisadores da Harvard Medical School e do EMBL-EBI realizaram a maior Análise entre tipos de câncer do recém descoberto fenômeno mutacional cromotripsis. Este estudo é o maior do seu tipo até à data, contendo dados de sequenciação do genoma inteiro (WGS) de mais de 2600 tumores abrangendo 38 tipos diferentes de cancro.
Cromotripsis
Cromotripsis, ou “quebrando cromossomo’, é um processo mutacional em que grandes trechos de um cromossomo sofrer enorme rearranjos em um único evento catastrófico. As regiões cromossômicas se fragmentam em pedaços menores, rearranjam e se reúnem, levando a uma nova configuração do genoma.
compreender plenamente como essas alterações impulsionam a evolução do genoma do câncer, e quais mecanismos moleculares estão envolvidos em sua geração, são passos importantes para a compreensão da evolução do genoma do câncer.
esta pesquisa foi publicada em genética da natureza como parte do projeto Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes (PCAWG), um esforço global envolvendo a colaboração internacional de mais de 1300 cientistas. Neste estudo, os pesquisadores mostraram que os eventos de cromotripsis são muito mais comuns em muitos tipos de câncer do que o pensamento anterior. Eles também podem ligar diretamente cromotripsis comuns características do genoma do câncer, incluindo a amplificação do oncogene (um aumento no número de cópias de um gene que pode causar câncer), e a perda de supressores de tumor (genes que regulam o crescimento celular e divisão).
Chromotripsis prevalence in cancer
“we integrated WGS data from over 2600 tumores spanning more than 30 cancer types,” says Isidro Cortés-Ciriano, Group Leader at EMBL-EBI and a former postdoctoral researcher at Harvard Medical School. “A partir disso descobrimos que os eventos de cromotripsis e outros tipos de rearranjos complexos do genoma são invasivos em todos os cancros humanos, com frequências superiores a 50% dos tumores em alguns tipos de câncer.”
Using WGS datasets gave the researchers an enhanced view of chromothripsis events in the cancer genome. Estudos anteriores olhando para o papel da cromotripsis no câncer e doenças congênitas muitas vezes usaram tecnologias de baixa resolução array-based. Aqui os pesquisadores foram capazes de mostrar que os eventos de cromotripsis são muito mais prevalentes no câncer do que anteriormente estimado. Eles também caracterizaram os padrões de alterações massivas do genoma através de tipos de câncer, e estudaram os mecanismos de reparação do DNA envolvidos em sua geração.
” This study is yet another demonstration of the power of large-scale whole-genome sequencing,” says Peter Park, Professor of Biomedical Informatics at Harvard Medical School and senior author of the paper. “Permitiu-nos sondar a desconcertante complexidade da destruição do genoma em genomas cancerígenos e caracterizar características comuns em centenas de casos.”
Cromotripsis and cancer prognosis
” The discoveries made in this project allow us to better understand how cancer arises and evolves, as well as the patterns of alterations in the DNA of human tumores,” says Cortés-Ciriano. “Algumas dessas alterações têm fortes implicações clínicas e podem abrir novas vias para o desenvolvimento terapêutico nos próximos anos.”
the researchers demonstrate that chromothripsis shapes the tumoral genome, leading to the loss of tumoral suppressor genes and amplification of oncogenes to drive cancer progression. A cromotripsia tem sido associada a mau prognóstico para pacientes com câncer, mas estudos contínuos como este nos ajudam a entender o impacto da cromotripsia e outras alterações genómicas em larga escala, e como eles podem ser usados para o diagnóstico de câncer no futuro.
the Pan-Cancer project
the Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes project is a collaboration involving more than 1300 scientists and clinicians from 37 countries. Envolveu a análise de mais de 2600 genomas de 38 tipos diferentes de tumores, criando um enorme recurso de genomas de câncer primário. Este foi o ponto de partida para 16 grupos de trabalho para estudar vários aspectos do desenvolvimento de câncer, causação, progressão e classificação.