Cromossomo territórios e a regulação global do genoma

posicionamento Espacial é um princípio fundamental que rege nuclear processos. A cromatina é organizada como uma hierarquia de nucleossomas para domínios cromatínicos Mbp (CD) ou domínios topologicamente associados (TADs) para compartimentos de nível superior, culminando em territórios cromossômicos (CT). Técnicas microscópicas e sequenciadoras têm fundamentado a organização cromatina como um fator crítico que regula a expressão do gene. Por exemplo, realçadores voltam para interagir com seus genes alvo quase exclusivamente dentro de TADs, genes Co-regulados localizados distalmente reposicionam-se em fábricas de transcrição comuns após a ativação, e CDs Mbp exibem movimento dinâmico e mudanças configuracionais in vivo. Uma questão de longa data no campo do núcleo é se uma matriz nuclear interativa fornece uma ligação direta entre estrutura e função. Os achados de posicionamento radial não-radial de TC dentro do núcleo sugerem a possibilidade de padrões de interação preferencial entre as populações de TC. A rotulagem sequencial de até 10 CT seguida pela aplicação de imagiologia computacional e algoritmos geométricos de mineração de grafos revelou redes de Intercâmbio específico de tipo celular (ICN) da CT que são alteradas durante o ciclo celular, diferenciação e progressão do câncer. Propõe-se que a RIC se correlacione com o nível global de regulação do genoma. Estas abordagens também demonstraram que a topologia em larga escala 3‐D da TC é específica para cada TC. A proximidade específica do tipo celular de certas regiões cromossómicas em células normais pode explicar a propensão de translocações distintas nos subtipos de cancro. Compreender como os genes são desregulados após a interrupção da “cablagem” normal do núcleo por translocações, deleções e amplificações que são marcas de câncer, deve permitir estratégias terapêuticas mais direcionadas.

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