a transmissão sináptica excitatória pode ser mediada através da alteração da capacidade de resposta dos receptores AMPA. Um método comum de alteração da capacidade de resposta é alterar o número de receptores AMPA na membrana pós-sináptica através de endocitose. Vários estímulos, incluindo CNQX, têm diversos efeitos na internalização do receptor AMPA. Conhecido por ser um antagonista competitivo do receptor AMPA/kainate, o CNQX é utilizado em estudos que investigam se a endocitose do receptor AMPA é ou não dependente do ligante. Em uma cultura de neurônios hipocampos, a CNQX inibiu parcialmente a internalização do receptor AMPA que foi estimulada pela AMPA. No entanto, quando os neurônios hipocampos foram tratados apenas com CNQX, a internalização do receptor AMPA ainda ocorreu tanto no soma como nos dendritos. O APV (antagonista do receptor NMDA) ou Nimodipina (bloqueador dos canais de cálcio ligado à tensão) também não foram capazes de bloquear esta internalização, sugerindo que a activação do receptor não é uma exigência para a endocitose do receptor AMPA. O tipo de receptores AMPA endocitados como resultado da estimulação CNQX também pode ser identificado usando CNQX. Nas células HEK marcadas com subunidades GluR, o CNQX estimula a internalização dos receptores GluR1 e GluR2. A região intracelular conservada tanto no GluR1 quanto no GluR2 na cauda C-terminal do GluR2 foi identificada e eliminada. A eliminação deste segmento resultou numa diminuição na endocitose constitutiva do receptor GluR2 nas células HEK, identificando a sequência que determina este efeito.
CNQX é conhecido por ser um antagonista selectivo competitivo para ambos os receptores AMPA, que têm um valor IC50 de 400 nM, e receptores kainate, que têm um valor IC50 de 4 µM. Também inibe de forma não-competitiva os receptores NMDA. O CNQX é assim utilizado para isolar as correntes pós-sinápticas inibitórias espontâneas mediadas pelo receptor GABAA. As ações da CNQX na frequência de correntes pós-sinápticas inibitórias espontâneas são independentes de suas ações nos receptores ionotrópicos de glutamato. Embora o valor EC50 do CNQX na frequência das correntes pós-sinápticas inibitórias espontâneas seja semelhante ao valor IC50 nos receptores de kainate, o bloqueio dos receptores de kainate não é responsável pelas acções do CNQX. O NBQX é um derivado da quinoxalina que se sabe ser mais eficaz do que o CNQX no bloqueio dos receptores do kainato, mas não houve um grande aumento na frequência das correntes pós-sinápticas inibitórias espontâneas. Além disso, os efeitos do CNQX não foram replicados pelo kynurenato (antagonista do receptor do glutamato) ou pelo NS-102 (bloqueador selectivo do receptor do kainato), uma vez que não houve aumento na frequência de correntes pós-sinápticas inibitórias espontâneas. Além disso, o D-AP5 e o 7-CIK não afectaram a frequência das correntes pós-sinápticas inibitórias espontâneas, provando que a acção dos receptores NMDA não tem em conta os efeitos do CNQX.