A análise da transcriptoma de células estaminais CD34 + identifica uma população semelhante à CFU-GEMM permissiva à infecção por citomegalovírus humano

ABSTRACT

as células mielóides são locais importantes de infecção lítica e latente por citomegalovírus humano (CMV). Nós mostramos anteriormente que apenas um pequeno subconjunto de células mielóides diferenciadas das células estaminais hematopoiéticas CD34+ é permissivo à replicação CMV, sublinhando a natureza heterogênea destas populações. A identidade exata dos tipos celulares suscetíveis e resistentes, e as características celulares caracterizando as células permissivas, no entanto, não poderiam ser dissecadas usando ferramentas de análise média transcriptional, como microarraias e, portanto, permaneceram enigmáticas. Aqui, nós analisamos os transcriptomas de 7000 células individuais no primeiro dia após a infecção usando a plataforma genômica 10X. Mostramos que as transcrições virais são detectáveis na maioria das células, sugerindo que a entrada de virião é improvável ser o alvo principal dos mecanismos de restrição celular. Nós também mostramos que a replicação viral ocorre em um pequeno mas específico subgrupo de células transcritivamente relacionadas a, e provavelmente derivadas de, um grupo de células expressando marcadores de unidades formadoras de colônias-granulócitos, eritrocitos, monócitos, megacariócitos (UFC – GEMM) progenitores oligopotentes. Em comparação com o resto da população, as células UFC-GEMM são enriquecidas em transcrições com funções na produção de energia mitocondrial, proliferação celular, processamento de RNA e síntese proteica, e expressam níveis semelhantes ou superiores de genes relacionados com o interferão. Enquanto os níveis de expressão dos primeiros são mantidos em células infectadas, os últimos são fortemente regulamentados para baixo. Assim, propomos que a infecção preferencial das células UFC-GEMM possa ser devido à presença de um ambiente pro-viral pré-estabelecido, exigindo esforços mínimos de otimização de efetores virais, em vez da ausência de fatores específicos de restrição. Em conjunto, estes resultados identificam uma população potencialmente Nova de células mielóides susceptíveis à replicação CMV e fornecem uma possível justificação para a sua infecção preferencial.

as células mielóides, tais como monócitos e células dendríticas, são alvos críticos da infecção por CMV. Para identificar os factores celulares que conferem susceptibilidade ou resistência à infecção, perfilámos os transcriptomas de 7.000 células individuais de uma população de células mielóides semi-permissivas infectadas com CMV. Descobrimos que viral Rna são detectáveis na maioria das células, mas que marcou a expressão de CMV líticas genes ocorre em apenas um pequeno subconjunto de células transcriptionally relacionadas a um cluster de CFU-GEMM progenitores que expressam quantidades semelhantes de transcrições de codificação de interferon-relacionadas com anti-viral, fatores como o resto da população, mas níveis mais elevados de transcrições de codificação de proteínas necessárias para a energia, RNA e proteína de produção. Assim, concluímos que a infecção preferencial das células UFC-GEMM pode ser devido à presença pré-existente de um ambiente intracelular conducente ao início da infecção, em vez da ausência de fatores anti-virais que restringem a entrada viral ou a expressão inicial do gene. Juntos, estes achados descobrem um novo tipo de células mielóides potencialmente permissivas à infecção por CMV, expandem o nosso entendimento dos Requisitos celulares para a iniciação bem sucedida da infecção por CMV, e fornecem novos candidatos ao gene pró – e anti-viral para futuras análises e intervenções terapêuticas.

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