wojna Czirokezów 1839 była kulminacją tarć pomiędzy Indianami Czirokezów, Kickapoo i Shawnee a białymi osadnikami w północno-wschodnim Teksasie. Indianie, którzy uzyskali prawa lokatorów do ziemi od władz hiszpańskich, zostali obiecani tytułem do ziemi w wyniku konsultacji; 23 lutego 1836 roku traktat zawarty przez Sama Houstona i Johna Forbesa, którzy reprezentowali rząd tymczasowy, nadał prawa do ziem między rzekami Angelina i Sabine oraz na północny zachód od starej drogi San Antonio do Cherokees i związanych z nimi zespołów. Traktat został przedłożony przez Senat Teksasu 29 grudnia 1836 roku i został uznany za nieważny przez ten organ 16 grudnia 1837 roku, pomimo nalegań Houston na jego ratyfikację. Rebelia Córdova w sierpniu 1838 roku spowodowała, że Thomas Jefferson Rusk maszerował na Czirokezów, próbując przechwycić Vicente Córdovę; Kordowa nie szukała jednak schronienia wśród Czirokezów i Rusk powrócił do osad. 16 października 1838 Rusk z 230 żołnierzami ścigał bandę Kickapoos, zniszczył ich wioskę i zabił jedenastu wojowników, w tym jednego renegata Cherokee. Jesienią 1838 roku i wiosną 1839 roku Indianie sporadycznie dokonywali najazdów.
po odkryciu, w maju 1839 roku, listu w posiadaniu Manuela Floresa, ujawniającego plany rządu meksykańskiego, aby zwerbować Indian przeciwko osadnikom z Teksasu, prezydent Mirabeau B. Lamar, poparty popularną opinią, postanowił wypędzić Indian ze Wschodniego Teksasu. W lipcu 1839 roku Kelsey H. Douglass został dowódcą około 500 żołnierzy pod dowództwem Edwarda Burlesona, Willisa H. Landrum i Ruska i otrzymał rozkaz usunięcia Indian na terytorium Arkansas. Armia rozbiła obóz w Council Creek, sześć mil na południe od głównej wioski Cherokee w Chief Bowl i 12 lipca wysłała Komisję do negocjacji w sprawie usunięcia Indian. Indianie zgodzili się podpisać traktat o usunięciu, który gwarantował im zysk z ich upraw i koszty usunięcia. W ciągu następnych dwóch dni nalegali na odejście, ale odmówili podpisania traktatu z powodu klauzuli, która zapewniłaby im zbrojną eskortę poza Republikę. 15 lipca komisarze powiedzieli Indianom, że Teksańczycy natychmiast pomaszerują na ich wioskę, a ci, którzy chcą zaakceptować traktat, powinni wywiesić białą flagę. Landrum został wysłany przez Neches, aby odciąć ewentualne posiłki, a reszta armii maszerowała na wieś. Bitwa pod Neches miała miejsce kilka mil na zachód od Tylera, na terenie dzisiejszego Hrabstwa Henderson. Do zachodu Słońca trzech Teksańczyków zostało zabitych i pięciu rannych; Indianie stracili osiemnastu. Indianie uciekli, a Douglass rozbił obóz. Pościg rozpoczął się rankiem 16 lipca. Grupa zwiadowcza pod dowództwem Jamesa Cartera zaatakowała Czirokezów w pobliżu dopływów rzeki Neches w miejscu, które znajduje się obecnie w hrabstwie Van Zandt. Indianie szukali schronienia w Chacie i okolicznych polach kukurydzy, ale zostali zmuszeni do opuszczenia ich po wzmocnieniu Cartera przez przybycie Ruska i Burlesona. Po trzydziestu minutach walk Indianie zostali zepchnięci na dno Neches, gdzie zginął Wódz, a wielu wojowników zginęło. Po ostatnich walkach pod Grand Saline oszacowano, że w starciach zginęło lub zostało rannych ponad 100 Indian.
21 lipca Teksańczycy pomaszerowali w kierunku ujścia rzeki Sabine wzdłuż szlaku zdobytego przez uciekających Indian. Liczne chaty i pola zostały zniszczone tego popołudnia, a kilka wiosek i ponad 200 akrów kukurydzy zostało spalonych rankiem 22 lipca. Zniszczenia kontynuowano w trakcie pościgu za Indianami, którego zaniechano dopiero 24 lipca. Większość Indian uciekła na ziemie Czirokezów poza granicami Republiki. Podczas zimy mała grupa pod dowództwem Chief Egga i Johna Bowlesa, syna Chief Bowla, próbowała dotrzeć do Meksyku, przedzierając się przez obrzeża białych osad. Burleson, podczas kampanii przeciwko Indianom z równin, przechwycił Czirokezów i zaatakował ich w pobliżu ujścia rzeki San Saba 25 grudnia 1839 roku. Egg, Bowles i kilku wojowników zostało zabitych, a dwadzieścia siedem kobiet i dzieci zostało schwytanych. Była to ostatnia ważna akcja przeciwko Czirokezom w Teksasie.