CodonCode Aligner-WINDOWSおよびMac OS X上のDNA配列アセンブリおよびアライメント

CodonCode Alignerは、windowsおよびMac OS Xで利用可能な配列アセンブリ、コンティグ編集、変異検出のためのプログラムです。AlignerはPhred-Phrapと互換性があり、シーケンス品質スコアを完全にサポートしていますが、次のスクリーンショットに示すように、使い慣れた、簡単に学ぶことができるユーザーインターフェイスを提供しています:

CodonCode Alignerを使用すると、次のことができます:

テキストファイルからのシーケンスのインポート	ABI、SCF、およびFASTQファイルからのシーケンスのインポート
エンドクリップ	ベクトルトリム
コンティグを組み立てる	参照シーケンスに整列する
トレースへのリンクを維持しながら、連続体を互いに整列させます	サンプルに基づいて、グループで組み立てるか、または一直線に並びます 名前
ヘテロ接合変異を見つける	ヘテロ接合体の挿入および欠失を分析する
低品質のコンセンサス領域など、関心領域（”フィーチャ”）を定義します	ユーザー定義機能間の迅速な移動
系統樹と制限マップの生成	AlignerプロジェクトからPhredとPhrapを直接実行する
シーケンスと機能のエクスポート	違い表とタンパク質の翻訳を参照してください
デザインプライマ	細菌ゲノムと小さなNGSシーケンスプロジェクトを組み立てます
&バーチャルゲルを作成するための酵素を見つける	メチル化配列の解析&生のトレースデータの表示

CodonCode Alignerを使用すると、次のことを最大限に活用できます 複雑なコマンドラインオプションやPerlプログラミングを学ぶことを強制することなく、基本呼び出しとシーケンスアセン

先に行くとCodonCode Alignerのデモ版をダウンロードしてください。 デモ版は、完全に機能するトレースビューアとエディタです。 初めてのユーザーは、CodonCode Alignerのすべての機能を試すことができる30日間の自動試用版を入手します。

ダウンロードした後、Alignerの最も重要な機能に慣れるために紹介ビデオを見ることをお勧めします。

私たちは時折、Facebook上でCodonCode Alignerの登録ファンに割引ライセンスを利用できるようにします-詳細については、Facebook上でCodonCode Alignerを確認してください！Facebook上の