Charles Chauncyはハーバード大学の第2代学長であるCharles Chauncyの曾孫でした。 チャールズはボストンで生まれ、教育を受けた。 1721年にハーバード大学を卒業し、1724年に修士号を取得した。 1727年にボストンの最初の教会の牧師に任命され、彼は60年間この権威ある地位に就いた。 1727年にエリザベス-タウンゼント、1738年にメアリー-ストッダード、1760年にエリザベス-タウンゼントと結婚した。 彼は真面目で勤勉な人で、宗教と聖書の精力的な学者でした。
チョウンシーは大覚醒の最も手ごわい評論家となった。 1741年、彼はニューイングランドの牧師ジョナサン・エドワーズの考えに非常に近い精神で講義を行ったが、一年後にチョウンシーはリバイバルに対して説教した。 彼の宗教の状態に関する季節外れの考え（1743）は、宗教的熱意に対する慎重に構築された論文です。 聖書を広く参照して、彼は暴走感情主義、精神的な誇り、妄想、および障害の時間として大覚醒を提示しました。 1744年にイギリスの偉大な伝道者ジョージ・ホイットフィールドがニューイングランドに戻ったとき、彼はハーバード大学でもイェール大学でも歓迎されず、ハーバード監督委員会のメンバーであったチョウンシーはこの瞬間を選んで、ホイットフィールドと目覚めの追放を説教した。
チョウンシーは自分自身をカルヴァン主義者と考えていたが、彼はいくつかの主要な点でカルヴァン主義を再解釈し、より正統派の同時代人が保持していた見解から方向を変えた。 彼は植民地の聖公会の設立に対して説教しました。 Chauncyは理性を”人としての私たちの性格”の本質として見て、それが人を救いに導くのに役立つと信じていました。 信仰と反対としての働きとの対比は、彼が感じた、過度に強調されていた。
常識の本質的な信頼性に対するチャンシーの信念は、未読であっても、神の慈悲に対する彼の自信から派生した。 彼は、キリストの死は人の救いのために必要であり、復讐の神をなだめるためではなく、この激変の出来事が罪人を神の権威に目覚めさせたからであると考えました。 チョウンシーは、キリストが選ばれた少数の者を贖うためではなく、全人類を救うために死なれたと感じ、原罪は帰された状態ではなく、単に先天的な傾向であると感じました。 彼は徐々に普遍主義とカルヴァン主義の三人の神ではなく、宇宙の単一の君主としての神の概念に向かって移動しました。 これらのテーマは、彼の影響力のあるCompleat View of Episcopacy（1771年）の基本的なものであり、他の二つの作品、The Benevolence of The Deitity（1784年）とThe Mystery Hid fromm Ages…or The Salvation of All Men…（1784年）、どちらもロンドンで匿名で出版されたが、明らかに1768年以前に書かれた。 チョウンシーの考え方は、19世紀のニューイングランド神学の発展を大きく予言した。